RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 GTF2BQ00403 316 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 RAB39AQ14964 217 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 XKR5Q6UX68 686 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 LHFPL5Q8TAF8 219 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SORT1Q99523 831 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 WDR11Q9BZH6 1224 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ANKHQ9HCJ1 492 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 CDC14AQ9UNH5 594 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 C6orf229H3BNL8 230 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 MSH4O15457 936 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 BANF1O75531 89 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 LSM8O95777 96 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 GSRP00390 522 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 KRT10P13645 584 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 HLCSP50747 726 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SELPLGQ14242 412 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.982e-16■■■■□ 26.2
GPBP1-208ENST00000514387 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 MAVSQ7Z434 540 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 TANKQ92844 425 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 HPS1Q92902 700 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 FEM1CQ96JP0 617 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 WDR41Q9HAD4 459 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SARDHQ9UL12 918 aa8.95□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SFI1A8K8P3 1242 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 DCXO43602 365 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 APOC2P02655 101 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 TGM1P22735 817 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ETV1P50549 477 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PRELPP51888 382 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 IST1P53990 364 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 GNG2P59768 71 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 RPP38P78345 283 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 CTBSQ01459 385 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ART3Q13508 389 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 CEACAM7Q14002 265 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF124Q15973 351 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 HADHQ16836 314 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SPATS1Q496A3 300 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 GPR107Q5VW38 600 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ADGRF2Q8IZF7 708 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 FAM47BQ8NA70 645 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 DPEP3Q9H4B8 488 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 NANOGQ9H9S0 305 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 KPNA7A9QM74 516 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 K7ENM7 598 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SEC14L2O76054 403 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 KRT3P12035 628 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF76P36508 570 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 STX1BP61266 288 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF33BQ06732 778 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 BNIP3Q12983 259 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 GALNT13Q8IUC8 556 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PJA1Q8NG27 643 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 CDC26Q8NHZ8 85 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ACTL9Q8TC94 416 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 DCAF4Q8WV16 495 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SEPT8Q92599 483 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SEMA4DQ92854 862 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 RTP4Q96DX8 246 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms