RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TK1	P04183	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	LCK	P06239	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CHN1	P15882	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PRPH2	P23942	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CHRNA5	P30532	468 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ACTR2	P61160	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	LRP5	O75197	1615 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	WNT1	P04628	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CAPN2	P17655	700 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	GSTM2	P28161	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PNPLA4	P41247	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	NR4A2	P43354	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TAF5	Q15542	800 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TWIST1	Q15672	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	IP6K1	Q92551	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CLPB	Q9H078	707 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	DERA	Q9Y315	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RAD50	Q92878	1312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	MST1R	Q04912	1400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TULP3	O75386	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TNNT1	P13805	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RHAG	Q02094	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PMPCA	Q10713	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	MMP21	Q8N119	569 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	NRAC	Q8N912	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	KAT2A	Q92830	837 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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