RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 MYBL1P10243 752 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 GRK6P43250 576 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 DNA2P51530 1060 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 UBASH3AP57075 661 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 TAS2R38P59533 333 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM193AP78312 1265 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNT1Q5JUK3 1230 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 LAYNQ6UX15 382 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 LUZP1Q86V48 1076 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 OXR1Q8N573 874 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 RHBDD1Q8TEB9 315 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 MAGEB5Q9BZ81 275 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 GDF3Q9NR23 364 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A1B0GTQ1 180 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 CD160O95971 181 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 PSMA2P25787 234 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 STAT4Q14765 748 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 PARP15Q460N3 678 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 SCINQ9Y6U3 715 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 WASF2Q9Y6W5 498 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM191CA6NGB0 347 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.453e-13■■■□□ 17.9
CTDSP1-211ENST00000492545 CREB3O43889 395 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 RNF8O76064 485 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 GSRP00390 522 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 WNT1P04628 370 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 ITGB7P26010 798 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 OGDHQ02218 1023 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 PYROXD2Q8N2H3 581 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 ARRDC3Q96B67 414 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 SCNM1Q9BWG6 230 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNK3O14649 394 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 POP4O95707 220 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 PBX1P40424 430 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 NEK3P51956 506 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 NXPH1P58417 271 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 VPS36Q86VN1 386 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 HORMAD1Q86X24 394 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 ISCUQ9H1K1 167 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A1W2PQU0 124 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM221BA6H8Z2 402 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 WNT9AO14904 365 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 RXRGP48443 463 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 ACAP1Q15027 740 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 ERMARDQ5T6L9 678 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXL19Q6PCT2 694 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF354CQ86Y25 554 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 OR2AP1Q8NGE2 309 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM174AQ8TBP5 190 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 RAB7BQ96AH8 199 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CTDSP1-211ENST00000492545 CHD5Q8TDI0 1954 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 BUB1O43683 1085 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 AP1G1O43747 822 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 FTH1P19P0C7X4 201 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 SKILP12757 684 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 NDST2P52849 883 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 TPI1P60174 286 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBED6P86452 979 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 RAD51Q06609 339 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF284Q2VY69 593 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF653Q96CK0 615 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 FEM1CQ96JP0 617 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 TM6SF2Q9BZW4 377 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 CAPN11Q9UMQ6 739 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 AP4E1Q9UPM8 1137 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 MSRB2Q9Y3D2 182 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 RASA4BC9J798 803 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 RASA4O43374 803 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 TNFSF14O43557 240 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 PRPSAP2O60256 369 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDH8O95206 1070 aa24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.7 ms