RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490566.1

TNS1-217, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-217ENST00000490566 CRHR1P34998 444 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 ADRA1AP35348 466 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 GP5P40197 560 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 ANO4Q32M45 955 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 USP41Q3LFD5 358 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 ALFQ53S48 1182 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 C1orf53Q5VUE5 145 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 RAP1GAP2Q684P5 730 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 MIB1Q86YT6 1006 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 CCDC63Q8NA47 563 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 SPATA22Q8NHS9 363 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 GIPC2Q8TF65 315 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 C10orf82Q8WW14 230 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 PTPRN2Q92932 1015 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 VWCEQ96DN2 955 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 IGSF21Q96ID5 467 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 CPNE1Q99829 537 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 FICDQ9BVA6 458 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 CCSER2Q9H7U1 834 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 MANSC1Q9H8J5 431 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 KLHL14Q9P2G3 628 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 CAPN7Q9Y6W3 813 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 GBF1Q92538 1859 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 CEP350Q5VT06 3117 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 TPP1O14773 563 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 KLF11O14901 512 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 TLR5O60602 858 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 UBOX5O94941 541 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 HMBSP08397 361 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 ITGA2BP08514 1039 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 RPL17P18621 184 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 BGNP21810 368 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 MAGEA12P43365 314 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 SEC13P55735 322 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 TNK2Q07912 1038 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 CCDC15Q0P6D6 951 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 MTA1Q13330 715 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 GALNTL6Q49A17 601 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 STXBP5Q5T5C0 1151 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 GRTP1Q5TC63 336 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 NADSYN1Q6IA69 706 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 DENND5AQ6IQ26 1287 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 FBXL22Q6P050 247 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 NDUFAF2Q8N183 169 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 MICALL1Q8N3F8 863 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 OVCA2Q8WZ82 227 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 IGSF8Q969P0 613 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 ISL2Q96A47 359 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 HMCESQ96FZ2 354 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 RBBP8Q99708 897 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 KIFC1Q9BW19 673 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 RASSF4Q9H2L5 321 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 RXFP1Q9HBX9 757 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 DONSONQ9NYP3 566 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 USH1CQ9Y6N9 552 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-217ENST00000490566 GLRA3O75311 464 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 UPP2O95045 317 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 TPH1P17752 444 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 TACR2P21452 398 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 OR1D2P34982 312 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 RFC2P35250 354 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 LIMK2P53671 638 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 IKBKEQ14164 716 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 DBN1Q16643 649 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 SNX30Q5VWJ9 437 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 FYB2Q5VWT5 728 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 KDELC1Q6UW63 502 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 KCNMB4Q86W47 210 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 TRIM42Q8IWZ5 723 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 PDZD8Q8NEN9 1154 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 IPMKQ8NFU5 416 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 ZNF398Q8TD17 642 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 MFSD3Q96ES6 412 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 TSSK1BQ9BXA7 367 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 SLC13A1Q9BZW2 595 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 SIRPGQ9P1W8 387 aa10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 SEC24AO95486 1093 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 SOD2P04179 222 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 NMBRP28336 390 aa10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms