RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490322.1

SMYD3-215, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMYD3, Length 368 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-215ENST00000490322 TRIM58Q8NG06 486 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 ABHD4Q8TB40 342 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 STT3BQ8TCJ2 826 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 SCFD2Q8WU76 684 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 TCP11Q8WWU5 503 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 ATRIPQ8WXE1 791 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 POMGNT1Q8WZA1 660 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 ANKRD7Q92527 254 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 MAML1Q92585 1016 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 GLG1Q92896 1179 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 SPSB4Q96A44 273 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM143Q96AN5 459 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 SDCCAG3Q96C92 435 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 C18orf8Q96DM3 657 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 SAAL1Q96ER3 474 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 SPATA33Q96N06 139 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 MOGAT1Q96PD6 335 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 ALS2CR12Q96Q35 445 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 MAP7D2Q96T17 732 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 CBWD1Q9BRT8 395 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 KIFC3Q9BVG8 833 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 C1orf43Q9BWL3 253 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 CARD6Q9BX69 1037 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 PORCNQ9H237 461 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 BRD9Q9H8M2 597 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 SMURF2Q9HAU4 748 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 TXNRD2Q9NNW7 524 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 SIX2Q9NPC8 291 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 SLAMF7Q9NQ25 335 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 AIPL1Q9NZN9 384 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 MORF4L1Q9UBU8 362 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 TRIM10Q9UDY6 481 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 NLRC5Q86WI3 1866 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 TANC1Q9C0D5 1861 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 THSD7BQ9C0I4 1608 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 COL1A2P08123 1366 aa3□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 A0A087WWL8 130 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 A0A087X0T9 212 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 CTAGE15A4D2H0 777 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 HMX3A6NHT5 357 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 SLC15A5A6NIM6 579 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF233A6NK53 670 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 NPIPB6E9PJ23 425 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 F8VZ95 297 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 K7ERI5 159 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF263O14978 683 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 PIP5K1BO14986 540 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 GRM6O15303 877 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 ASNA1O43681 348 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 STRNO43815 780 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 EXTL3O43909 919 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 HBP1O60381 514 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 HAUS5O94927 633 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 IL18BPO95998 194 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 GH1P01241 217 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 PIGRP01833 764 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 POLBP06746 335 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 C8BP07358 591 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 GRPP07492 148 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 ADRB2P07550 413 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 FAM228BP0C875 321 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 CTAGE8P0CG41 777 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 RAP2AP10114 183 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 CYP2C9P11712 490 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 NPPBP16860 134 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 PFKLP17858 780 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 EGR1P18146 543 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 GLRA2P23416 452 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 CNTFP26441 200 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 MARK3P27448 753 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 MAPK4P31152 587 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 GTF2H1P32780 548 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 THBS2P35442 1172 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 ARL2P36404 184 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 ADCY8P40145 1251 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.936e-6■■■■□ 20.3
SMYD3-215ENST00000490322 ETV4P43268 484 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 GCLMP48507 274 aa2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
SMYD3-215ENST00000490322 EFNA5P52803 228 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms