RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 CIITAP33076 1130 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 HTR6P50406 440 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 OAZ1P54368 228 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SLC12A2P55011 1212 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CDH15P55291 814 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 RPP30P78346 268 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 GHRHRQ02643 423 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PMPCAQ10713 525 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 GPR68Q15743 365 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PLK5Q496M5 336 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 C5orf22Q49AR2 442 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 LRIG3Q6UXM1 1119 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CYB5R4Q7L1T6 521 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CHD1LQ86WJ1 897 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CNTROBQ8N137 903 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 NANOGP1Q8N7R0 232 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 FAM47BQ8NA70 645 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 NCSTNQ92542 709 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PREBQ9HCU5 417 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 THSD1Q9NS62 852 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 COG5Q9UP83 839 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 OSGIN2Q9Y236 505 aa3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TTC3P53804 2025 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 OR6C68A6NDL8 312 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TNFSF14O43557 240 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SLC25A17O43808 307 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TULP3O75386 442 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CHRM4P08173 479 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 FGF2P09038 288 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TNNT1P13805 278 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TNFRSF1BP20333 461 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ELF1P32519 619 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ICAM3P32942 547 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 HARS2P49590 506 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ID2Q02363 134 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 AADACL2Q6P093 401 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 KDELC2Q7Z4H8 507 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 WDR5BQ86VZ2 330 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 LRRC57Q8N9N7 239 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 FAR1Q8WVX9 515 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 HSPH1Q92598 858 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 FRG2BQ96QU4 278 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CTAGE1Q96RT6 745 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 MAP6D1Q9H9H5 199 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PEMTQ9UBM1 199 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 HEY2Q9UBP5 337 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CDH22Q9UJ99 828 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ANAPC4Q9UJX5 808 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.5□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CBY3A6NI87 242 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TEX22C9J3V5 150 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 F8W810 466 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SNAP23O00161 211 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SOCS2O14508 198 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 STRNO43815 780 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 HBP1O60381 514 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TACC1O75410 805 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SERPINC1P01008 464 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CD63P08962 238 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CHRNA5P30532 468 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TNFSF8P32971 234 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 STAT1P42224 750 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PLCD1P51178 756 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 UFM1P61960 85 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 RPS13P62277 151 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 EFNB1P98172 346 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SLC18A2Q05940 514 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 GOLGA8FQ08AF8 430 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PTP4A2Q12974 167 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 MTX1Q13505 466 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ERV3-1Q14264 604 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 C6orf10Q5SRN2 563 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms