RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A14Q9UN76 642 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 J3KR12 359 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 SLC7A4O43246 635 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF11O60813 436 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 LEFTY1O75610 366 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TMCC1O94876 653 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 FSBPO95073 299 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 GSRP00390 522 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 IGHV4-34P06331 123 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 SERPINF2P08697 491 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 IL4RP24394 825 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 MAGEA1P43355 309 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 ID4P47928 161 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 ADPRHP54922 357 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 CDH6P55285 790 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 MESDQ14696 234 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 AGBL4Q5VU57 503 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0895LQ68EN5 471 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TP53INP2Q8IXH6 220 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 OR14C36Q8NHC7 312 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 ORAI3Q9BRQ5 295 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 PDFQ9HBH1 243 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 SUSD2Q9UGT4 822 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 PI4KAP42356 2102 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 FAM47DPA6NHR8 397 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 LRRC72A6NJI9 287 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 CFIP05156 583 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 CD48P09326 243 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP25P42331 645 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 LIMK1P53667 647 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 KRT81Q14533 505 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 CYTH1Q15438 398 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 LZTR1Q8N653 840 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 OR2AP1Q8NGE2 309 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 EDEM2Q9BV94 578 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GTW7 788 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 SLC30A4O14863 429 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 GNSP15586 552 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 CDC25BP30305 580 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 GKP32189 559 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 GJC1P36383 396 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 MYLK3Q32MK0 819 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TMTC1Q8IUR5 882 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 SNX19Q92543 992 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 EBF2Q9HAK2 575 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 FSCN3Q9NQT6 498 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 DFFAO00273 331 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 KRT7P08729 469 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 ENGP17813 658 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 SDHBP21912 280 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 CD27P26842 260 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 CCR5P51681 352 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R38P59533 333 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 RHOAP61586 193 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 MMRN1Q13201 1228 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 DPYSL3Q14195 570 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 STPG1Q5TH74 334 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 OR6K2Q8NGY2 324 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 HDAC8Q9BY41 377 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 KDM4CQ9H3R0 1056 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 LHX3Q9UBR4 397 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D3EA0A087X179 549 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D3LB9A6J9 549 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 POP4O95707 220 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D3HP0C7X1 549 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 PPP2CBP62714 309 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 PPP2CAP67775 309 aa21.28■■□□□ 1
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