RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	MAFK	O60675	156 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PALM	O75781	387 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RHOBTB1	O94844	696 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	EPN2	O95208	641 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	IL1B	P01584	269 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PRNP	P04156	253 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	OXTR	P30559	389 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PTPN7	P35236	360 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	DRD3	P35462	400 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	METAP1	P53582	386 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RHOA	P61586	193 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	GBE1	Q04446	702 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	CYTH1	Q15438	398 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PPP2R5E	Q16537	467 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ODF2	Q5BJF6	829 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TMIE	Q8NEW7	156 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	FATE1	Q969F0	183 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	FAM122A	Q96E09	287 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	DTL	Q9NZJ0	730 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	IL36A	Q9UHA7	158 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RNF103	O00237	685 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	APOL1	O14791	398 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	SLC7A4	O43246	635 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	LEFTY1	O75610	366 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MAP3K6	O95382	1288 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	FTCD	O95954	541 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	IGSF6	O95976	241 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RET	P07949	1114 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MX2	P20592	715 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ACSL1	P33121	698 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PEX5	P50542	639 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	DNA2	P51530	1060 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	COPS2	P61201	443 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TFDP2	Q14188	446 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	LPAL2	Q16609	132 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	AGBL4	Q5VU57	503 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PEX26	Q7Z412	305 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RFX6	Q8HWS3	928 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MAML1	Q92585	1016 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ALG3	Q92685	438 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	HDAC11	Q96DB2	347 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	OLFM3	Q96PB7	478 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TSGA13	Q96PP4	275 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PSKH2	Q96QS6	385 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	SGK2	Q9HBY8	427 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	SEPT3	Q9UH03	358 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	AMFR	Q9UKV5	643 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MUSK	O15146	869 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MATN3	O15232	486 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MAP3K13	O43283	966 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	GFRA3	O60609	400 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	NDUFS2	O75306	463 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	SEMA4F	O95754	770 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87

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