RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 CNTN5O94779 1100 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CBX6O95503 412 aa6.31□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 IRF1P10914 325 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 C6P13671 934 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 BMPR1AP36894 532 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PIK3CAP42336 1068 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ADPRHP54922 357 aa6.31□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 FAM189BP81408 668 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TMF1P82094 1093 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 GPAT4Q86UL3 456 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.31□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 AMER2Q8N7J2 671 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF18AQ8NI77 898 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.31□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ABI3Q9P2A4 366 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 FZD4Q9ULV1 537 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 DHDHQ9UQ10 334 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 KNSTRNQ9Y448 316 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBC2A0A5B9 178 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 USP12O75317 370 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 KLC4Q9NSK0 619 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 CHL1O00533 1208 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PRYO14603 147 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 C22orf31O95567 290 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINC1P01008 464 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 STMN1P16949 149 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM11P17152 192 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CDAP32320 146 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 MCM7P33993 719 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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