RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467065.1

UBXN4-205, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN4, Length 334 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-205ENST00000467065 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.76□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 HYOU1Q9Y4L1 999 aa6.76□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.76□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.76□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.76□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 PTPRBP23467 1997 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 AKAP13Q12802 2813 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 CACNA1BQ00975 2339 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 A0A1B0GVM2 712 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 DFFAO00273 331 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 NPC1O15118 1278 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 MTSS1O43312 755 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 RAMP2O60895 175 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 NDUFS2O75306 463 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF217O75362 1048 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 IGLV3-25P01717 112 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 ADRB1P08588 477 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 KRT10P13645 584 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 PRLRP16471 622 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 ENGP17813 658 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 KDELR1P24390 212 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 MAPKAPK2P49137 400 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 COPAP53621 1224 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 TUBB4BP68371 445 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 RAD51Q06609 339 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF33AQ06730 810 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 SLC20A2Q08357 652 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 ITKQ08881 620 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 SCAPQ12770 1279 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 LMAN2Q12907 356 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 PTPRNQ16849 979 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 PARP15Q460N3 678 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 ACCSLQ4AC99 568 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 CFAP58Q5T655 872 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 MBLAC2Q68D91 279 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 RFX8Q6ZV50 586 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 FAM124AQ86V42 546 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 VSIG1Q86XK7 387 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 AHI1Q8N157 1196 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 SLC39A13Q96H72 371 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF670Q9BS34 389 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 CARD9Q9H257 536 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 MTG2Q9H4K7 406 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 SP110Q9HB58 689 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 KCND1Q9NSA2 647 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 GGA2Q9UJY4 613 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 VPS28Q9UK41 221 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 TFR2Q9UP52 801 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 HEY1Q9Y5J3 304 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 USP24Q9UPU5 2620 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 RCCD1A6NED2 376 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 MEI4A8MW99 385 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 ESPNB1AK53 854 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN4-205ENST00000467065 H7C0C1 242 aa6.74□□□□□ -1.33
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