RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 PLCD3Q8N3E9 789 aa24.64■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SPATA22Q8NHS9 363 aa24.64■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.533e-7■■■■□ 24.4
NME4-209ENST00000460297 GOLGA8MH3BSY2 632 aa24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 DYNC1I1O14576 645 aa24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 NDC80O14777 642 aa24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 NIPAL4Q0D2K0 466 aa24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 MBLAC2Q68D91 279 aa24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ANKRD7Q92527 254 aa24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 MGME1Q9BQP7 344 aa24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SLC25A51Q9H1U9 297 aa24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 UBP1Q9NZI7 540 aa24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 DEC1Q9P2X7 70 aa24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 COL4A2P08572 1712 aa24.63■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 E7EVH7 732 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 GJB3O75712 270 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 TPSB2P20231 275 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 RGRP47804 291 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 STK19P49842 368 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 DSC2Q02487 901 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ITKQ08881 620 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 IHHQ14623 411 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 TPSAB1Q15661 275 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 KCTD11Q693B1 232 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 BBS5Q8N3I7 341 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 PHTF2Q8N3S3 785 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ARRDC2Q8TBH0 407 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 TTC17Q96AE7 1141 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 PRDM6Q9NQX0 595 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 MMP2P08253 660 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SLC20A2Q08357 652 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ALG1LQ6GMV1 187 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 GRAMD4Q6IC98 578 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SLC44A3Q8N4M1 653 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 LHX3Q9UBR4 397 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 HS3ST2Q9Y278 367 aa24.62■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SMAPO00193 183 aa24.61■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 IL9P15248 144 aa24.61■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ECT2LQ008S8 904 aa24.61■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 KDSRQ06136 332 aa24.61■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SULT2A1Q06520 285 aa24.61■■□□□ 1.53
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NME4-209ENST00000460297 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa24.61■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 NXPE3Q969Y0 559 aa24.61■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 EXOC2Q96KP1 924 aa24.61■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24.61■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SEMA3CQ99985 751 aa24.61■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 PRRT4C9JH25 899 aa24.6■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ERLIN1O75477 346 aa24.6■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 AP2A1O95782 977 aa24.6■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ASGR2P07307 311 aa24.6■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SRCP12931 536 aa24.6■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 CR2P20023 1033 aa24.6■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 GRIA1P42261 906 aa24.6■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 OLIG2Q13516 323 aa24.6■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 PRPSAP1Q14558 356 aa24.6■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ATP11CQ8NB49 1132 aa24.6■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SORCS1Q8WY21 1168 aa24.6■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ANXA9O76027 345 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 CD86P42081 329 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SOX9P48436 509 aa24.59■■□□□ 1.53
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NME4-209ENST00000460297 SPARCL1Q14515 664 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 MAP9Q49MG5 647 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 EMBQ6PCB8 327 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ZNF534Q76KX8 674 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 RNF135Q8IUD6 432 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SFTPA1Q8IWL2 248 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SH2D3CQ8N5H7 860 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 MCUQ8NE86 351 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 TADA1Q96BN2 335 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 NSMCE3Q96MG7 304 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 SLC25A13Q9UJS0 675 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ANKRD36A6QL64 1941 aa24.59■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
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