RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 NNMTP40261 264 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 MMP13P45452 471 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 RPS9P46781 194 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 RGRP47804 291 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP5OP48047 213 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CSNK1DP48730 415 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 STK19P49842 368 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 RENBPP51606 427 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SEC13P55735 322 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ST8SIA6P61647 398 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ECT2LQ008S8 904 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 LMNB2Q03252 620 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 AP1B1Q10567 949 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 FZD5Q13467 585 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SNX1Q13596 522 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 IHHQ14623 411 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM71DQ8N9W8 422 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CCNYQ8ND76 341 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 GRK7Q8WTQ7 553 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 NSMCE3Q96MG7 304 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 KRT12Q99456 494 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 GABRG3Q99928 467 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 GBA3Q9H227 469 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SEPT3Q9UH03 358 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC25A13Q9UJS0 675 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 PLA2G4CQ9UP65 541 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ERVW-1Q9UQF0 538 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF148Q9UQR1 794 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ACTL7AQ9Y615 435 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 TECTAO75443 2155 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ANTXRLA6NF34 631 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 WASH3PC4AMC7 463 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RNF40O75150 1001 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 GAS8O95995 478 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 GSRP00390 522 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 JCHAINP01591 159 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DCNP07585 359 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MMP2P08253 660 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CHRNB1P11230 501 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TIE1P35590 1138 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DR1Q01658 176 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CBLBQ13191 982 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SEMA5AQ13591 1074 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 C2orf27AQ580R0 203 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 EOGTQ5NDL2 527 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MARC1Q5VT66 337 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 LINGO4Q6UY18 593 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC105Q8IYK2 499 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 USP33Q8TEY7 942 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SORCS1Q8WY21 1168 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FCRL5Q96RD9 977 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CHRDQ9H2X0 955 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PAK5Q9P286 719 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 HPCAL4Q9UM19 191 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SGK1O00141 431 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TTI1O43156 1089 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 LAMTOR5O43504 91 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 METTL18O95568 372 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 IL12RB1P42701 662 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms