RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447966.6

ASIC1-202, Transcript of acid sensing ion channel subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ASIC1, Length 3,778 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1-202ENST00000447966 STK39Q9UEW8 545 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 STRNO43815 780 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 IL10P22301 178 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 NFKBIAP25963 317 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 CPOXP36551 454 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 CLDN10P78369 228 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 TRAF2Q12933 501 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 SLC44A4Q53GD3 710 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 DHFR2Q86XF0 187 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 MIB1Q86YT6 1006 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 NCLNQ969V3 563 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 RTKNQ9BST9 563 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 NAT9Q9BTE0 207 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 RNF39Q9H2S5 420 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 NT5MQ9NPB1 228 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 MYRFQ9Y2G1 1151 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 RAP2CQ9Y3L5 183 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 MYL3P08590 195 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 NR2C2P49116 596 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 DNERQ8NFT8 737 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 KLHL5Q96PQ7 755 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 GMLQ99445 158 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 DGCR6LQ9BY27 220 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 FAM50BQ9Y247 325 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 MSI1O43347 362 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 ATP6V1G1O75348 118 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 E2F6O75461 281 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 GCATO75600 419 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 GSSP48637 474 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 NAA20P61599 178 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 STX5Q13190 355 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 CYP51A1Q16850 503 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 VPS26BQ4G0F5 336 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 SPANXN3Q5MJ09 141 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 CBR4Q8N4T8 237 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 TEPSINQ96N21 525 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 PIGVQ9NUD9 493 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 KLHL33A6NCF5 533 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 PTGES3LE9PB15 166 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 SNNO75324 88 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 TSHRP16473 764 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 CHRM3P20309 590 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 TAF6P49848 677 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 TAS2R39P59534 338 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 MAPK11Q15759 364 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 CARTPTQ16568 116 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 OR6J1Q8NGC5 347 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 C1orf50Q9BV19 199 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 CROTQ9UKG9 612 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 OR51F1A6NGY5 319 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 PLSCR1O15162 318 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 CLOCKO15516 846 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 ATICP31939 592 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 LIPMQ5VYY2 423 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 XKR5Q6UX68 686 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 CNTN6Q9UQ52 1028 aa16.03■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 YJEFN3A6XGL0 299 aa16.02■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.02■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 LIMK2P53671 638 aa16.02■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 ADGRE1Q14246 886 aa16.02■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 ZNF534Q76KX8 674 aa16.02■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 LPPQ93052 612 aa16.02■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 ARMC7Q9H6L4 198 aa16.02■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 MID1IP1Q9NPA3 183 aa16.02■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ASIC1-202ENST00000447966 BEST1O76090 585 aa16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 PIGRP01833 764 aa16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 TPSB2P20231 275 aa16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 MATKP42679 507 aa16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 TPSAB1Q15661 275 aa16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 PFKFB4Q16877 469 aa16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 BDNFP23560 247 aa16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 PTPN3P26045 913 aa16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 PCSK6P29122 969 aa16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 SLC5A3P53794 718 aa16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 MTTPP55157 894 aa16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 CDH17Q12864 832 aa16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 GRIK4Q16099 956 aa16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 PERM1Q5SV97 790 aa16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
ASIC1-202ENST00000447966 GIPC3Q8TF64 312 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms