RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 CYP4F3Q08477 520 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 CDO1Q16878 200 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 PROX2Q3B8N5 592 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL19Q6PCT2 694 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 RFFLQ8WZ73 363 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 NTAN1Q96AB6 310 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 LRIG1Q96JA1 1093 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 GPR27Q9NS67 375 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 CA5BQ9Y2D0 317 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 RAXQ9Y2V3 346 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 NSFP46459 744 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 HDAC4P56524 1084 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 RPS21P63220 83 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 RAB6CQ53S08 254 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 GCNT7Q6ZNI0 430 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 C3orf20Q8ND61 904 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 JOSD2Q8TAC2 188 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 NXPE2Q96DL1 559 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEH1Q9H213 219 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 NDFIP2Q9NV92 336 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 FANCLQ9NW38 375 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 FADS3Q9Y5Q0 445 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 LOC400499M0QZD8 3231 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087WV48 116 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 A6NNZ2 444 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 LRIG2O94898 1065 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 PCDH8O95206 1070 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 KRT3P12035 628 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 JUPP14923 745 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 HES3Q5TGS1 186 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A45Q8N413 288 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 OR13H1Q8NG92 308 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 OR4C6Q8NH72 309 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 GPT2Q8TD30 523 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 RAB7BQ96AH8 199 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 FZD3Q9NPG1 666 aa21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 LGALS16A8MUM7 142 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 FAM72CH0Y354 149 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 SDC3O75056 442 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 GSRP00390 522 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 CALB1P05937 261 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 DGKAP23743 735 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ACVRL1P37023 503 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 MYL5Q02045 173 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 SYCP1Q15431 976 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 FAM72AQ5TYM5 149 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 SEL1L3Q68CR1 1132 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 FAM72DQ6L9T8 149 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 FAM72BQ86X60 149 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 KLK6Q92876 244 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 FEM1CQ96JP0 617 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 MYOCQ99972 504 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 SLC17A9Q9BYT1 436 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 APC2O95996 2303 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ACACAQ13085 2346 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 RAMP2O60895 175 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 GPD1P21695 349 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 COL28A1Q2UY09 1125 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 HS1BP3Q53T59 392 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC185Q8N715 623 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 NEK11Q8NG66 645 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 OR2AP1Q8NGE2 309 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ASB12Q8WXK4 309 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 VOPP1Q96AW1 172 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 CALN1Q9BXU9 219 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 NRSN2Q9GZP1 204 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms