RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 ZFP14Q9HCL3 533 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NT5MQ9NPB1 228 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ABCB8Q9NUT2 735 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 VPS28Q9UK41 221 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CDH7Q9ULB5 785 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0D9SEW6 157 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 EPOPA6NHQ4 379 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CBX4O00257 560 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ZMPSTE24O75844 475 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 USP1O94782 785 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ALDH1A2O94788 518 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SYF2O95926 243 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 AGTP01019 485 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ASLP04424 464 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 HLA-DQB2P05538 268 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CEBPBP17676 345 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PGAM1P18669 254 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 HLA-DPA1P20036 260 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ADRA1DP25100 572 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ADRA1AP35348 466 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NNMTP40261 264 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 IRAK1P51617 712 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NRLP54845 237 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NTHL1P78549 312 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF844Q08AG5 666 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 KRT71Q3SY84 523 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM135Q86UB9 458 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MFSD6LQ8IWD5 586 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.852e-6■■■□□ 18.6
HDLBP-211ENST00000425989 OR7D4Q8NG98 312 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 USP33Q8TEY7 942 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CDKL2Q92772 493 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 FGF13Q92913 245 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ATP2A3Q93084 1043 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MYEOVQ96EZ4 313 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 FEM1CQ96JP0 617 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 LMLNQ96KR4 655 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 RANBP9Q96S59 729 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 BBS2Q9BXC9 721 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ADGRE3Q9BY15 652 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CEP44Q9C0F1 390 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 S1PR5Q9H228 398 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ACSS3Q9H6R3 686 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SENP1Q9P0U3 644 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 IKBKGQ9Y6K9 419 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 RFXAPO00287 272 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 INSIG1O15503 277 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CSPG5O95196 566 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ACSL3O95573 720 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PRKCHP24723 683 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CNTFP26441 200 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MSH2P43246 934 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 WNT3AP56704 352 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 AP1S1P61966 158 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 FAM193AP78312 1265 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PDE1BQ01064 536 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 RAD51Q06609 339 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CDK18Q07002 472 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJC3Q13217 504 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 COL19A1Q14993 1142 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 DHCR24Q15392 516 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CYTH1Q15438 398 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MSS51Q4VC12 460 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 FAM78AQ5JUQ0 283 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 FAXCQ5TGI0 409 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 STEAP4Q687X5 459 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms