RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 AFG1LQ8WV93 481 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 HMCESQ96FZ2 354 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 C8orf76Q96K31 380 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 PRR25Q96S07 402 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 MLXIPQ9HAP2 919 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 SH3GLB2Q9NR46 395 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 SMC3Q9UQE7 1217 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 BTBD18B2RXH4 712 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 DNM1LO00429 736 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 CTAGE5O15320 804 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 FIBPO43427 364 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ATP9AO75110 1047 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 VNN1O95497 513 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 TDP2O95551 362 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 NTN1O95631 604 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 MMP1P03956 469 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ASGR1P07306 291 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 MMP3P08254 477 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ARP10275 920 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 HTR1BP28222 390 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 MCM2P49736 904 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 CPT1AP50416 773 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 LRRC26Q2I0M4 334 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 XRRA1Q6P2D8 792 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 HSCBQ8IWL3 235 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 TBCKQ8TEA7 893 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 GJA10Q969M2 543 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 SPATA33Q96N06 139 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 MMS19Q96T76 1030 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 FAM118BQ9BPY3 351 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 MXRA8Q9BRK3 442 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 HTATIP2Q9BUP3 242 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 STARD7Q9NQZ5 370 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ASIC5Q9NY37 505 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 CITO14578 2027 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 MYO7AQ13402 2215 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 KIF28PB7ZC32 967 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 FAM86B1E9PN63 330 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 H3BQV1 296 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 AP4M1O00189 453 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 CHMP2AO43633 222 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 AP1G1O43747 822 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 STAM2O75886 525 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 UBXN7O94888 489 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 CST5P28325 142 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ICAM3P32942 547 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 PRKAG1P54619 331 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 TBX4P57082 545 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 NEDD9Q14511 834 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 FAM187BQ17R55 369 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 LETM2Q2VYF4 491 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 HSDL1Q3SXM5 330 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 TRIM60Q495X7 471 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 CEP55Q53EZ4 464 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 PLA1AQ53H76 456 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 GALNT17Q6IS24 598 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 DAAM2Q86T65 1068 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 SFTPA1Q8IWL2 248 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 KLHDC9Q8NEP7 349 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 OR6B3Q8NGW1 331 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 GLT1D1Q96MS3 346 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 NT5C1BQ96P26 610 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 SDF4Q9BRK5 362 aa4.84□□□□□ -1.63
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