RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 RICTORQ6R327 1708 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 A8MX80 341 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 TBL1XO60907 577 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM58BPP0C7Q3 252 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 GRK4P32298 578 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 SOX6P35712 828 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM237Q96Q45 408 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 BBS4Q96RK4 519 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CLUHO75153 1309 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A088AWK7 358 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 C1DQ13901 141 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 PTPN20Q4JDL3 420 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CES5AQ6NT32 575 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 JOSD2Q8TAC2 188 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CORO1BQ9BR76 489 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 PTPRHQ9HD43 1115 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 MEI4A8MW99 385 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 MLYCDO95822 493 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 PROCP04070 461 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 IL5RAQ01344 420 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 PDK4Q16654 411 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 DOK6Q6PKX4 331 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 SELENOMQ8WWX9 145 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 KLQ9UEF7 1012 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 FBXO5Q9UKT4 447 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 FGF1P05230 155 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 TCF3P15923 654 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 TFEBP19484 476 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 BRCC3P46736 316 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 RAB10P61026 200 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CDK18Q07002 472 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM187BQ17R55 369 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 OR6Y1Q8NGX8 325 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 DLG3Q92796 817 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 TM6SF2Q9BZW4 377 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 SNX6Q9UNH7 406 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 KLHL20Q9Y2M5 609 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CNTNAP1P78357 1384 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ARL2P36404 184 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 VSTM1Q6UX27 236 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 RDH11Q8TC12 318 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 TRPC4APQ8TEL6 797 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 RNF145Q96MT1 663 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 RGS5O15539 181 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 BUD23O43709 281 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CILPO75339 1184 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 TNNI3P19429 210 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ABL2P42684 1182 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 PTPRNQ16849 979 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM228AQ86W67 206 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 FNIP1Q8TF40 1166 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 GDPD5Q8WTR4 605 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 PLIN4Q96Q06 1357 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ITGA2BP08514 1039 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ADRA1BP35368 520 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ITGA7Q13683 1181 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 DDR2Q16832 855 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF621Q6ZSS3 439 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 RNF148Q8N7C7 305 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ELMO1Q92556 727 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 MAGED4Q96JG8 741 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CLOCKO15516 846 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ANXA6P08133 673 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CXCR2P25025 360 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CTNNB1P35222 781 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 THOP1P52888 689 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4-203ENST00000409212 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms