RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402521.7

EFTUD2-201, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,045 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-201ENST00000402521 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 NKX3-2P78367 333 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 COG7P83436 770 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 CDKL1Q00532 357 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 ITGA7Q13683 1181 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 NIPAL1Q6NVV3 410 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 RNF180Q86T96 592 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 DSELQ8IZU8 1212 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 PDPRQ8NCN5 879 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 CFAP36Q96G28 342 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 CPXM1Q96SM3 734 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 MIOSQ9NXC5 875 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 PCSK1NQ9UHG2 260 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-201ENST00000402521 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 ZBTB14O43829 449 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 POMCP01189 267 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 RALBP11234 206 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 CCL5P13501 91 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 MTM1Q13496 603 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 ANKFN1Q8N957 763 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 OR6B3Q8NGW1 331 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 JOSD2Q8TAC2 188 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 RNF157Q96PX1 679 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 OLAHQ9NV23 265 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 IPPQ9Y573 584 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 AP4S1Q9Y587 144 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 A0A1W2PQY0 241 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 TRIM38O00635 465 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 DPYSL4O14531 572 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 PIK3R1P27986 724 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 ADORA2BP29275 332 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 ESRRGP62508 458 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 IKBKEQ14164 716 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 UBXN11Q5T124 520 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 NETO2Q8NC67 525 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 HSPBAP1Q96EW2 488 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 GAD1Q99259 594 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 OLFM1Q99784 485 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 INIPQ9NRY2 104 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 USP18Q9UMW8 372 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 KPNA7A9QM74 516 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 M0QYV0 167 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 CLDN5O00501 218 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 PIAS1O75925 651 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 MAP3K6O95382 1288 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 ATP6V1B1P15313 513 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 CST5P28325 142 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 NR2C2P49116 596 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 CSRP3P50461 194 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 THOP1P52888 689 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 ARHGEF6Q15052 776 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 MOGQ16653 247 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 CDO1Q16878 200 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 PTPN20Q4JDL3 420 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 CCDC80Q76M96 950 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 XYLT1Q86Y38 959 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 CLEC4CQ8WTT0 213 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 PKP2Q99959 881 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF670Q9BS34 389 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 COG4Q9H9E3 785 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 TRPV5Q9NQA5 729 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 TCF7L2Q9NQB0 619 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-201ENST00000402521 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms