RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 NIF3L1Q9GZT8 377 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 MARCH2Q9P0N8 246 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 USP54Q70EL1 1684 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CYP26A1O43174 497 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CAMTA2O94983 1202 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 PGLSO95336 258 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 NUDT17P0C025 328 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 NQO1P15559 274 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 PTPRAP18433 802 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 TUBP50607 506 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CYTH1Q15438 398 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 NDUFAF6Q330K2 333 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 C20orf194Q5TEA3 1177 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 SMYD1Q8NB12 490 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 MCEEQ96PE7 176 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 ITGA11Q9UKX5 1188 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 NCANO14594 1321 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 SIN3BO75182 1162 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 USP2O75604 605 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 SUPT7LO94864 414 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 EOMESO95936 686 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 IGHDP01880 384 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 ITGA3P26006 1051 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 MECP2P51608 486 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 RUNX2Q13950 521 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 C12orf60Q5U649 245 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 EXOC3L1Q86VI1 746 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 SNX32Q86XE0 403 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CYTH2Q99418 400 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 MTMR12Q9C0I1 747 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CAB39LQ9H9S4 337 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 C1orf167Q5SNV9 1468 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 B4DGG1 531 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 TBX3O15119 743 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 SLC26A4O43511 780 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 ALPIP09923 528 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 S100A5P33763 92 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 UGT1A5P35504 534 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 SERPINB10P48595 397 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 DNASE1L1P49184 302 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 PTK7Q13308 1070 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 ITPK1Q13572 414 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 LYSMD4Q5XG99 296 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 SPATA21Q7Z572 469 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 RAB43Q86YS6 212 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 KLHDC7BQ96G42 594 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 LMAN2LQ9H0V9 348 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 ING3Q9NXR8 418 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 GIT1Q9Y2X7 761 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 PLD2O14939 933 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 ACSL3O95573 720 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 PRNPP04156 253 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 BMP7P18075 431 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 NMT1P30419 496 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 GHRHRQ02643 423 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 STK32CQ86UX6 486 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 TRPV3Q8NET8 790 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 VPS35Q96QK1 796 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 PDE7BQ9NP56 450 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 INTUQ9ULD6 942 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CDYLQ9Y232 598 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 TMEM150CB9EJG8 249 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 H3BQ06 376 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 RXRGP48443 463 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 ACLYP53396 1101 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CAV3P56539 151 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 ARF5P84085 180 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CAP1Q01518 475 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CBWD6Q4V339 395 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 ENPP7Q6UWV6 458 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CHST9Q7L1S5 443 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 OTOP1Q7RTM1 612 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 SLC29A4Q7RTT9 530 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CCDC197Q8NCU1 140 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 ATP8B4Q8TF62 1192 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CMTM5Q96DZ9 223 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 MGAT4AQ9UM21 535 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 MAPRE3Q9UPY8 281 aa4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
CENPF-201ENST00000366955 OR6C75A6NL08 312 aa4.17□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms