RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 M0QYT0 321 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAPN9O14815 690 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCXO43602 365 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 COQ9O75208 318 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLDN14O95500 239 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CKMT1AP12532 417 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYF5P13349 255 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 MCM3P25205 808 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 SHC1P29353 583 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCTDP32321 178 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPL3P39023 403 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYP2J2P51589 502 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXL2P58012 376 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 EVA1CP58658 441 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 GNB1P62873 340 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TLE3Q04726 772 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP1A4Q13733 1029 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNAI3Q3KNW1 292 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 RRAGBQ5VZM2 374 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRNIPQ6NTE8 343 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 MSANTD2Q6P1R3 559 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC30A9Q6PML9 568 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRTC1Q6UUV9 634 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEACAM20Q6UY09 585 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM74Q86UV6 250 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM73Q86UV7 250 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC28AQ8IWP9 274 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 BMPERQ8N8U9 685 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC24A4Q8NFF2 622 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPATA22Q8NHS9 363 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC22A17Q8WUG5 538 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CPT1BQ92523 772 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 FIG4Q92562 907 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHMP4CQ96CF2 233 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTBPQ96DY7 904 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAR2Q96K12 515 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRR1Q96L50 414 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM51Q9BSJ1 452 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 NMRK2Q9NPI5 230 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 FSCN3Q9NQT6 498 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM160Q9NX00 188 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMOD4Q9NZQ9 345 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEL1LQ9UBV2 794 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 IP6K2Q9UHH9 426 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIX4Q9UIU6 781 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDH22Q9UJ99 828 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 OGDHLQ9ULD0 1010 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TPCN1Q9ULQ1 816 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 VDAC3Q9Y277 283 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 PKP3Q9Y446 797 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A0G2JPF8 293 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 hDV102S1A0JD36 115 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 C17orf102A2RUQ5 167 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ALG1L2C9J202 215 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 HHLA1C9JL84 531 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 NKX2-8O15522 239 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDH7O60245 1069 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAGE7O76087 117 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 MMP3P08254 477 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITGA5P08648 1049 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAGE12FP0CL80 117 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAGE12GP0CL81 117 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAGE12IP0CL82 117 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSPA6P17066 643 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 LIFRP42702 1097 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCR10P46092 362 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 FMO5P49326 533 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLCNKBP51801 687 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADORA2A-AS1P86434 159 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYP4A11Q02928 519 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAGE1Q13065 139 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAGE4Q13068 117 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNFAIP1Q13829 316 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 AAK1Q2M2I8 961 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLK5Q496M5 336 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYTL3Q4VX76 610 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM171A1Q5VUB5 890 aa0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms