RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PCID2Q5JVF3 399 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TSGA13Q96PP4 275 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 GCNAQ96QF7 691 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CDRT15Q96T59 188 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TINF2Q9BSI4 451 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TKTL2Q9H0I9 626 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 VCX3AQ9NNX9 186 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 XPR1Q9UBH6 696 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ACOT9Q9Y305 439 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CD1EP15812 388 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CCR10P46092 362 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 LHX1P48742 406 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 RAB10P61026 200 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ADGRE1Q14246 886 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PKN3Q6P5Z2 889 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 LSMEM2Q8N112 164 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM86AQ8N2M4 240 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ZMIZ2Q8NF64 920 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 LRGUKQ96M69 825 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CATSPER2Q96P56 530 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 HAPLN3Q96S86 360 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 WDR41Q9HAD4 459 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 NUP205Q92621 2012 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 AVPR1AP37288 418 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 GRIA2P42262 883 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 GRB14Q14449 540 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PPP2R5DQ14738 602 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CNGA3Q16281 694 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 NXNQ6DKJ4 435 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CNTD1Q8N815 330 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 MOCOSQ96EN8 888 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PCED1BQ96HM7 432 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TBL1YQ9BQ87 522 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 EPB41L1Q9H4G0 881 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 EFCAB1Q9HAE3 211 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ACSS2Q9NR19 701 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 NDUFA13Q9P0J0 144 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 RIMS3Q9UJD0 308 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PACSIN3Q9UKS6 424 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 RAB26Q9ULW5 256 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC78A2IDD5 438 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PDHXO00330 501 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 DLX3O60479 287 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 AHSGP02765 367 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 STMN1P16949 149 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 YY1P25490 414 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 GABRB3P28472 473 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CLCN2P51788 898 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 RABGGTBP53611 331 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 MFSD10Q14728 455 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TLR1Q15399 786 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PM20D1Q6GTS8 502 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 BHLHA9Q7RTU4 235 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 GPR142Q7Z601 462 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SENP8Q96LD8 212 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SNX10Q9Y5X0 201 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 MYLKQ15746 1914 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TRPC5OSA6NMA1 111 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 NPHS1O60500 1241 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ANXA9O76027 345 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ME2P23368 584 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ADAM17P78536 824 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ART3Q13508 389 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CEACAM7Q14002 265 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM198Q66K66 360 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 OTOP3Q7RTS5 596 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 JUNP05412 331 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ADCY4Q8NFM4 1077 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 NAT14Q8WUY8 206 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 IRGQQ8WZA9 623 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 EDEM1Q92611 657 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SMARCD1Q96GM5 515 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms