RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 CNBD2Q96M20 576 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ACSS3Q9H6R3 686 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PDP2Q9P2J9 529 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPRE3Q9UPY8 281 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 BUD23O43709 281 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PAGE1O75459 146 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CTSEP14091 401 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SMPD1P17405 629 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PFKPQ01813 784 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ENPEPQ07075 957 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAF2Q12933 501 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ADRM1Q16186 407 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PFKFB4Q16877 469 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 IYDQ6PHW0 289 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 IL27RAQ6UWB1 636 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 C11orf74Q86VG3 221 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CPXM1Q96SM3 734 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 IKZF4Q9H2S9 585 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PIK3C2AO00443 1686 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEA13PA6NCF6 341 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CXCR2P25025 360 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINB3P29508 390 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 HPCAL1P37235 193 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PTPRNQ16849 979 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 C16orf46Q6P387 395 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 BBS4Q96RK4 519 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MOXD2PA6NHM9 499 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 GSTM1P09488 218 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 POU1F1P28069 291 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCG1P45844 678 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR1P46091 355 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SULT2A1Q06520 285 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PWP1Q13610 501 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CRYMQ14894 314 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CHMP1BQ7LBR1 199 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 IRGQQ8WZA9 623 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RAD21L1Q9H4I0 556 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SAR1AQ9NR31 198 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO5Q9UKT4 447 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR25O00155 361 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGEF9O43307 516 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 DCXO43602 365 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 LBPP18428 481 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ALG3Q92685 438 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 BTBD10Q9BSF8 475 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 GNRH1P01148 92 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 FTH1P02794 183 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 WNT3AP56704 352 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NUP107P57740 925 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MBTD1Q05BQ5 628 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 DHFR2Q86XF0 187 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SYT12Q8IV01 421 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SELENOMQ8WWX9 145 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 P2RY11Q96G91 374 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0U1RQJ8 604 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ADH1CP00326 375 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RAET1GQ6H3X3 334 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CDK20Q8IZL9 346 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SPPL2AQ8TCT8 520 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM220BPB1ANY3 271 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CST3P01034 146 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NUDT17P0C025 328 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V1B1P15313 513 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX32Q86XE0 403 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 BDH2Q9BUT1 245 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 B3GNT5Q9BYG0 378 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM245Q9H330 911 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CYLDQ9NQC7 956 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC167Q9P0B6 97 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 AP4S1Q9Y587 144 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEC1O60732 1142 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MLYCDO95822 493 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 IL1BP01584 269 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ME2P23368 584 aa16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms