RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 RPL14P50914 215 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 MED21Q13503 144 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 BRD8Q9H0E9 1235 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 HDAC3O15379 428 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 F8W810 466 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 ABCB7O75027 752 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 THRAP10827 490 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 TSPAN8P19075 237 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 PMLP29590 882 aa7.37□□□□□ -1.23
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