RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326828.5

CHRNA3-201, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 3 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHRNA3, Length 3,202 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3-201ENST00000326828 CD300CQ08708 224 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 GEN1Q17RS7 908 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 DEFB106AQ8N104 65 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 SLCO4A1Q96BD0 722 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 LRCH3Q96II8 777 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 TMEM114B3SHH9 223 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 PGK2P07205 417 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 BAG6P46379 1132 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 NR2C2P49116 596 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 GNA12Q03113 381 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 TRAF2Q12933 501 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 LSMEM2Q8N112 164 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 BBS5Q8N3I7 341 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 RNF139Q8WU17 664 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 POMKQ9H5K3 350 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF232Q9UNY5 417 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 SH3PXD2BA1X283 911 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 GRM1Q13255 1194 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 ASB9Q96DX5 294 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 SPON1Q9HCB6 807 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 SMOXQ9NWM0 555 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 MRASO14807 208 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 COQ9O75208 318 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 DDHD2O94830 711 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 ARIH2O95376 493 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 SBK3P0C264 359 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 UGT1A1P22309 533 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 UGT1A4P22310 534 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 UGT1A3P35503 534 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 UGT1A5P35504 534 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 CASP2P42575 452 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 NUP107P57740 925 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 PRKCQQ04759 706 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 CSHL1Q14406 222 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 TBCELQ5QJ74 424 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 CNSTQ6PJW8 725 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 CARM1Q86X55 608 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF597Q96LX8 424 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 RANBP9Q96S59 729 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 INIPQ9NRY2 104 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 WDR81Q562E7 1941 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 FAM72CH0Y354 149 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 KCNH1O95259 989 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 LRPAP1P30533 357 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 C21orf59P57076 290 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 ADRM1Q16186 407 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 KIF19Q2TAC6 998 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 FAM72AQ5TYM5 149 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 REP15Q6BDI9 236 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 FAM72DQ6L9T8 149 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 FAM83AQ86UY5 434 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 FAM72BQ86X60 149 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 CXorf38Q8TB03 319 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 ELMO2Q96JJ3 720 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 M0QYT0 321 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 B4GAT1O43505 415 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 MPOP05164 745 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 MLNP12872 115 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 LMO2P25791 158 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 RHDQ02161 417 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 PMS2P3Q13401 168 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 C4orf22Q6V702 233 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 DHFR2Q86XF0 187 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 CEP97Q8IW35 865 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 MAML3Q96JK9 1138 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 GMLQ99445 158 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 NME7Q9Y5B8 376 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 K7EPI3 171 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 IL18RAPO95256 599 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 NCAM1P13591 858 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 NFKB1P19838 968 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRNA3-201ENST00000326828 CHRM3P20309 590 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms