RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 KIF9Q9HAQ2 790 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 PLAC1Q9HBJ0 212 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 SYBUQ9NX95 663 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 SZT2Q5T011 3432 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 SDR42E2A6NKP2 422 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 RASGRF2O14827 1237 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 CD160O95971 181 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 PHBP35232 272 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 CD86P42081 329 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 LMAN2Q12907 356 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 IHHQ14623 411 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 KDELC1Q6UW63 502 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 APCDD1Q8J025 514 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 DNAAF3Q8N9W5 541 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 TBL1YQ9BQ87 522 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 FICDQ9BVA6 458 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 SEPT3Q9UH03 358 aa24.19■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 GJB3O75712 270 aa24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 AGTP01019 485 aa24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 ADRA1AP35348 466 aa24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 MPP3Q13368 585 aa24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 FAM78AQ5JUQ0 283 aa24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 KCTD16Q68DU8 428 aa24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 LINGO4Q6UY18 593 aa24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 LINC00523Q86TU6 105 aa24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 FBF1Q8TES7 1133 aa24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 IRF7Q92985 503 aa24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 SPHK2Q9NRA0 654 aa24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 VPS51Q9UID3 782 aa24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 RABGEF1Q9UJ41 708 aa24.18■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 TCEA3O75764 348 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 PENKP01210 267 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 CD70P32970 193 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 VIPR2P41587 438 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 ADAM15Q13444 863 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 CYTH1Q15438 398 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 PCSK7Q16549 785 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 CASC4Q6P4E1 433 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 BBS5Q8N3I7 341 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 DCAF4L2Q8NA75 395 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 ASB16Q96NS5 453 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 PSKH2Q96QS6 385 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 SEMA3CQ99985 751 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 MGME1Q9BQP7 344 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 CCDC77Q9BR77 488 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 BBS2Q9BXC9 721 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 WNT3AP56704 352 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 CDH17Q12864 832 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 LY6G5CQ5SRR4 150 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 UNC5AQ6ZN44 842 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 TADA1Q96BN2 335 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 OTUB2Q96DC9 234 aa24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 SPAG6O75602 509 aa24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 RGRP47804 291 aa24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 SKOR1P84550 965 aa24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 CERCAMQ5T4B2 595 aa24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 ALG1LQ6GMV1 187 aa24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 CROCCP2Q86T23 111 aa24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 SH2D3CQ8N5H7 860 aa24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 LMLNQ96KR4 655 aa24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 FSD1LQ9BXM9 530 aa24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 VPS45Q9NRW7 570 aa24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 BFARQ9NZS9 450 aa24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 CLEC1BQ9P126 229 aa24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa24.16■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 IVLP07476 585 aa24.15■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 TPH1P17752 444 aa24.15■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 GCAP28676 217 aa24.15■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 SKIDA1Q1XH10 827 aa24.15■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 DENND5AQ6IQ26 1287 aa24.15■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 KDELC2Q7Z4H8 507 aa24.15■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 SMARCD2Q92925 531 aa24.15■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 EXOC2Q96KP1 924 aa24.15■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 ACSS3Q9H6R3 686 aa24.15■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 PIAS1O75925 651 aa24.14■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 TMCC1O94876 653 aa24.14■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 TYRP14679 529 aa24.14■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 HLA-FP30511 346 aa24.14■■□□□ 1.46
TMIE-201ENST00000326431 PLEKHG6Q3KR16 790 aa24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms