RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SPON2Q9BUD6 331 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 UGT1A7Q9HAW7 530 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 UGT1A10Q9HAW8 530 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 UGT1A8Q9HAW9 530 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CLEC4EQ9ULY5 219 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PPM1 405 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MDH1P40925 334 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CD86P42081 329 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH17Q12864 832 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ALG14Q96F25 216 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 NSMCE3Q96MG7 304 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 FICDQ9BVA6 458 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 BFARQ9NZS9 450 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMD3O43242 534 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MSH2P43246 934 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CHRNA4P43681 627 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 GEMP55040 296 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 WNT3AP56704 352 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ARF5P84085 180 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 KDELC2Q7Z4H8 507 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00523Q86TU6 105 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CCNJLQ8IV13 435 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CPXM2Q8N436 756 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SH3RF2Q8TEC5 729 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF778Q96MU6 729 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF599Q96NL3 588 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 NAT9Q9BTE0 207 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TASP1Q9H6P5 420 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP13A1Q9HD20 1204 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CHRAC1Q9NRG0 131 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP9BO43861 1147 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ZMPSTE24O75844 475 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 NEBLO76041 1014 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEF12O95522 483 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 NPY2RP49146 381 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MPP3Q13368 585 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC6Q86X45 466 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PPM1NQ8N819 430 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MFSD3Q96ES6 412 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 GDF15Q99988 308 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 IL22Q9GZX6 179 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PLK2Q9NYY3 685 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC17A6Q9P2U8 582 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 EYSQ5T1H1 3165 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 H0Y626 953 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MYO1CO00159 1063 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CBX4O00257 560 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SNAP91O60641 907 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 FGF19O95750 216 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP5DP30049 168 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RGRP47804 291 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 OXCT1P55809 520 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ITKQ08881 620 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNC3Q14003 757 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PCSK7Q16549 785 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF43Q68DV7 783 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 GDPD5Q8WTR4 605 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 NSMCE1Q8WV22 266 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC17Q96AE7 1141 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 HMX2A2RU54 273 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 XYLBO75191 536 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CHN1P15882 459 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms