RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 SEMA3CQ99985 751 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 SAMD15Q9P1V8 674 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 TRHDEQ9UKU6 1024 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 GOLGA8CPA6NN73 597 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 TRIM49D1C9J1S8 452 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 PYGBP11216 843 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 SAT1P21673 171 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 WNT3AP56704 352 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 IRX4P78413 519 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 GPR158Q5T848 1215 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 TMC5Q6UXY8 1006 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 CEP128Q6ZU80 1094 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 TRIM74Q86UV6 250 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 TRIM73Q86UV7 250 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 LRRC6Q86X45 466 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 GSDMBQ8TAX9 411 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 DDI1Q8WTU0 396 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ATP13A1Q9HD20 1204 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 GRID1Q9ULK0 1009 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 KCTD3Q9Y597 815 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa11.15□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 CCDC85CA6NKD9 419 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 TRIM24O15164 1050 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 BNIP3LO60238 219 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 GREM1O60565 184 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 TCEA3O75764 348 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 RHOCP08134 193 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 CA4P22748 312 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 SCNN1BP51168 640 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 NDST2P52849 883 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 GALNT3Q14435 633 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 PRPSAP1Q14558 356 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 SLC1A5Q15758 541 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 ITIH5Q86UX2 942 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 ACVR1CQ8NER5 493 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 TBL1YQ9BQ87 522 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 LINC00597Q9H2U6 94 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 IGFLR1Q9H665 355 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 ASAH2Q9NR71 780 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 COMMD8Q9NX08 183 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 BFARQ9NZS9 450 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 SLC17A7Q9P2U7 560 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 LGALS13Q9UHV8 139 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 RAD54BQ9Y620 910 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 HMX2A2RU54 273 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 WASH4PA8MWX3 477 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 MTSS1O43312 755 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 MMP2P08253 660 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 WEE1P30291 646 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 TMPRSS15P98073 1019 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 DENND5AQ6IQ26 1287 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 C4orf22Q6V702 233 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 TAOK1Q7L7X3 1001 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 GDPD5Q8WTR4 605 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 ERLEC1Q96DZ1 483 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 CASS4Q9NQ75 786 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 SMAPO00193 183 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 NDC80O14777 642 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 HGSO14964 777 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 PRAMEF12O95522 483 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 RHOP08100 348 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 GKP32189 559 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 CCT5P48643 541 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 RENBPP51606 427 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 WDR4P57081 412 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF235Q14590 738 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 RASSF3Q86WH2 238 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 CMTM8Q8IZV2 173 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 APCDD1Q8J025 514 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 RMI1Q9H9A7 625 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms