RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267328.4

RAB20-201, Transcript of RAB20, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB20, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20-201ENST00000267328 PLPP6Q8IY26 295 aa24.03■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 C10orf88Q9H8K7 445 aa24.03■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 USP29Q9HBJ7 922 aa24.03■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 CFAP69A5D8W1 941 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 GSRP00390 522 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 HOXB2P14652 356 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 PTPN3P26045 913 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 RHOAP61586 193 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 WASHC5Q12768 1159 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 ZNF235Q14590 738 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 Q6ZVU0 165 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 PBXIP1Q96AQ6 731 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 VAT1Q99536 393 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 FERMT1Q9BQL6 677 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 MGME1Q9BQP7 344 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 MTG2Q9H4K7 406 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 CD248Q9HCU0 757 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 SEPT10Q9P0V9 454 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB20-201ENST00000267328 A0A1W2PQF6 199 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 MUSKO15146 869 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 JCHAINP01591 159 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 ITGAVP06756 1048 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 SNX1Q13596 522 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 TUBB2AQ13885 445 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 TEX44Q53QW1 395 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 C9orf64Q5T6V5 341 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 PGBD5Q8N414 524 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 SPEM1Q8N4L4 309 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 OR2AP1Q8NGE2 309 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 OR2A12Q8NGT7 310 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 TUBB2BQ9BVA1 445 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 TM6SF2Q9BZW4 377 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 TNKS2Q9H2K2 1166 aa24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 KCNN4O15554 427 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 PHF2O75151 1096 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 SIN3BO75182 1162 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 STARD3Q14849 445 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 CRY1Q16526 586 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 CARD16Q5EG05 197 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 CNTD1Q8N815 330 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 CCDC114Q96M63 670 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 TMEM121Q9BTD3 319 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 NT5MQ9NPB1 228 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 PRSS16Q9NQE7 514 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 ZNF148Q9UQR1 794 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 MRFAP1Q9Y605 127 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 IGSF6O95976 241 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 HLA-DQB2P05538 268 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 CR2P20023 1033 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 COL9A1P20849 921 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 STIP1P31948 543 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 CSNK1DP48730 415 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 ALG1LQ6GMV1 187 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 TMEM92Q6UXU6 159 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 MAMSTRQ6ZN01 415 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 FBXL6Q8N531 539 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 RTP4Q96DX8 246 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 TEKT5Q96M29 485 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 CEP41Q9BYV8 373 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 HAUS2Q9NVX0 235 aa24■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 RNF103O00237 685 aa23.99■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 NEBLO76041 1014 aa23.99■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 RGRP47804 291 aa23.99■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 GDF10P55107 478 aa23.99■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 MTAPQ13126 283 aa23.99■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa23.99■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 KIAA1211LQ6NV74 962 aa23.99■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa23.99■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 ZNF567Q8N184 647 aa23.99■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 EXOC2Q96KP1 924 aa23.99■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 FBRSQ9HAH7 460 aa23.99■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 C5orf60A6NFR6 353 aa23.98■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 CCDC188H7C350 402 aa23.98■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 ALOX15BO15296 676 aa23.98■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 COILP38432 576 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 KCNJ1P48048 391 aa23.98■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 FNTAP49354 379 aa23.98■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 MAXP61244 160 aa23.98■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 TTC27Q6P3X3 843 aa23.98■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 FAM71DQ8N9W8 422 aa23.98■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 C2orf42Q9NWW7 574 aa23.98■■□□□ 1.43
RAB20-201ENST00000267328 TRHDEQ9UKU6 1024 aa23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms