RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PMF1Q6P1K2 205 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RFX6Q8HWS3 928 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 UNC45BQ8IWX7 931 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC17Q96AE7 1141 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 HESX1Q9UBX0 185 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 MUTYHQ9UIF7 546 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 CHMP2BQ9UQN3 213 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RBP3P10745 1247 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 BGNP21810 368 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 VIPR2P41587 438 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 BCAT1P54687 386 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SARNPP82979 210 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TFDP2Q14188 446 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RCN2Q14257 317 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNJ11Q14654 390 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TANGO2Q6ICL3 276 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 C4orf22Q6V702 233 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35F5Q8WV83 523 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO32Q969P5 355 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RSPRY1Q96DX4 576 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 GMIPQ9P107 970 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPN14A8MX76 684 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 CIB2O75838 187 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF8O76064 485 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PYGBP11216 843 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 FCARP24071 287 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 BST2Q10589 180 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52E8Q6IFG1 317 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC39Q96DD0 335 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB16Q96NS5 453 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 KXD1Q9BQD3 176 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM33Q9BZ11 813 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf21Q9H246 121 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 GPAMQ9HCL2 828 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 GDE1Q9NZC3 331 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PAK5Q9P286 719 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF840PA6NDX5 716 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNFP41002 786 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 GPD2P43304 727 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SESN3P58005 492 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT15Q8N3T1 639 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM71DQ8N9W8 422 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 NRG4Q8WWG1 115 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP295NLQ96MC4 621 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC3BQ96PB8 259 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPC7Q9HCX4 862 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 OSER1Q9NX31 292 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PLLPQ9Y342 182 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO16Q9Y6X6 1858 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM92AA1XBS5 289 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ENO4A6NNW6 628 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF12O95522 483 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L7P0C7H9 530 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 IL1R2P27930 398 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 HTR4Q13639 388 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 NOMO1Q15155 1222 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 IFT43Q96FT9 208 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 NMUR1Q9HB89 426 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL26Q9Y258 94 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 BIRC5O15392 142 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB41Q5JT25 222 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 AP1ARQ63HQ0 302 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 GATA6Q92908 595 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF38Q9H0F5 515 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ASNSD1Q9NWL6 643 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TJP2Q9UDY2 1190 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TAGLN3Q9UI15 199 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ANHXE9PGG2 379 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPN20Q4JDL3 420 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RIN3Q8TB24 985 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 GCNAQ96QF7 691 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TASP1Q9H6P5 420 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SIRPGQ9P1W8 387 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 USP3Q9Y6I4 520 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 B2RBV5 119 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TM7SF2O76062 418 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ENDOD1O94919 500 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKCHP24723 683 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TKTL1P51854 596 aa26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms