RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233084.7

DDX1-201, Transcript of DEAD-box helicase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX1, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1-201ENST00000233084 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 ASB9Q96DX5 294 aa16■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 SDCBP2Q9H190 292 aa16■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 MUC3BQ9H195 1237 aa16■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 VTA1Q9NP79 307 aa16■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 RIC8BQ9NVN3 520 aa16■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 HES2Q9Y543 173 aa16■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 SPO11Q9Y5K1 396 aa16■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 MGAMO43451 1857 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 H0YJX3 145 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 GPR25O00155 361 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 KCNA2P16389 499 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 NAT1P18440 290 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 RHDQ02161 417 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 CAMK2BQ13554 666 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 STXBP5Q5T5C0 1151 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 GPR142Q7Z601 462 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 CYP26B1Q9NR63 512 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 DGKBQ9Y6T7 804 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 SNAP91O60641 907 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 IDUAP35475 653 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 PSME3P61289 254 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 TAP1Q03518 808 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 TAZQ16635 292 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 TIGD2Q4W5G0 525 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 DENND1BQ6P3S1 775 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 PQLC3Q8N755 202 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 SNX31Q8N9S9 440 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 PEBP4Q96S96 227 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 RSAD1Q9HA92 442 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 TXNDC16Q9P2K2 825 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa15.99■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 CCDC162PA2VCL2 907 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 GMNNO75496 209 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 MYO1DO94832 1006 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 CD19P15391 556 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 HDCP19113 662 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 TPTEP56180 551 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 GALNT2Q10471 571 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 ORC1Q13415 861 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 C17orf99Q6UX52 265 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 TTC30AQ86WT1 665 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 DOK1Q99704 481 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 ADI1Q9BV57 179 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 PALMDQ9NP74 551 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 AURKCQ9UQB9 309 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 PSMD11O00231 422 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 HMGCRP04035 888 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 IRF9Q00978 393 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 CRHR2Q13324 411 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 BFSP2Q13515 415 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 GRB14Q14449 540 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 ZNF792Q3KQV3 632 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 TNIP2Q8NFZ5 429 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 ACMSDQ8TDX5 336 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 CNDP1Q96KN2 507 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 C1orf50Q9BV19 199 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 CEP44Q9C0F1 390 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 MOCS1Q9NZB8 636 aa15.98■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 TCAF2A6NFQ2 919 aa15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 CCNE2O96020 404 aa15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 CST3P01034 146 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 ERVK-10P10266 1014 aa15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 CNTFP26441 200 aa15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 ICAM3P32942 547 aa15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 OPRL1P41146 370 aa15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 SP2Q02086 613 aa15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 OXA1LQ15070 435 aa15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 PLCL1Q15111 1095 aa15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 STILQ15468 1287 aa15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 DLG2Q15700 870 aa15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 DSG4Q86SJ6 1040 aa15.97■□□□□ 0.15
DDX1-201ENST00000233084 OLFM1Q99784 485 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms