RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ACCSLQ4AC99 568 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 HSCBQ8IWL3 235 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LGI2Q8N0V4 545 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ARL10Q8N8L6 244 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TMC2Q8TDI7 906 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 NKD1Q969G9 470 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ABHD17AQ96GS6 310 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SLC39A13Q96H72 371 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CATSPER2Q96P56 530 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LRRN3Q9H3W5 708 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CNGB3Q9NQW8 809 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 STMND1H3BQB6 276 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SEMA7AO75326 666 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ME1P48163 572 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ARSDP51689 593 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PFN3P60673 137 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC15Q0P6D6 951 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 BST2Q10589 180 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 KLRB1Q12918 225 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM174Q8WUU8 243 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 KCTD13Q8WZ19 329 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ALG14Q96F25 216 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A13Q9UJS0 675 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TSPAN16Q9UKR8 245 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 AKAP9Q99996 3911 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PRR19A6NJB7 356 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
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SPCS1-201ENST00000233025 TSHRP16473 764 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 GNLYP22749 145 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ATP1A2P50993 1020 aa16.78■□□□□ 0.28
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SPCS1-201ENST00000233025 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 NNTQ13423 1086 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ATL3Q6DD88 541 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TMIEQ8NEW7 156 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA5Q8TBA6 731 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CMKLR1Q99788 373 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 HDAC8Q9BY41 377 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CISHQ9NSE2 258 aa16.78■□□□□ 0.28
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SPCS1-201ENST00000233025 SERTAD1Q9UHV2 236 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TLR6Q9Y2C9 796 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 MED13LQ71F56 2210 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CSMD2Q7Z408 3487 aa16.78■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 NAV3Q8IVL0 2385 aa16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 BNIP3LO60238 219 aa16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TACR2P21452 398 aa16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CHRNA3P32297 505 aa16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 STK4Q13043 487 aa16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RAP1GAP2Q684P5 730 aa16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PCDH19Q8TAB3 1148 aa16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 GPBAR1Q8TDU6 330 aa16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 KCTD10Q9H3F6 313 aa16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 GULP1Q9UBP9 304 aa16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RCOR1Q9UKL0 485 aa16.77■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PCNX1Q96RV3 2341 aa16.77■□□□□ 0.28
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SPCS1-201ENST00000233025 FPGTO14772 594 aa16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 LTFP02788 710 aa16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 LCP1P13796 627 aa16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 C16orf72Q14CZ0 275 aa16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CHSY1Q86X52 802 aa16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CCNJLQ8IV13 435 aa16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 GALNT11Q8NCW6 608 aa16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 OR2A12Q8NGT7 310 aa16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 IRGQQ8WZA9 623 aa16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PMEPA1Q969W9 287 aa16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SERPINB11Q96P15 392 aa16.76■□□□□ 0.27
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