RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216484.6

SPTLC2-201, Transcript of serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTLC2, Length 8,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2-201ENST00000216484 PPM1BO75688 479 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 URODP06132 367 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF234Q14588 700 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 EML3Q32P44 896 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SYNMO15061 1565 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 TRIM38O00635 465 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 OGTO15294 1046 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 THRBP10828 461 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 MGAT5Q09328 741 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 MARC1Q5VT66 337 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SNX32Q86XE0 403 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 APBB2Q92870 758 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 EMC3Q9P0I2 261 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.77□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 A0A087X1B8 175 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 MID1O15344 667 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SERPINE1P05121 402 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 PRKAA2P54646 552 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 PARGQ86W56 976 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 FAM210AQ96ND0 272 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 VPS4AQ9UN37 437 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 CCNKO75909 580 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 TTKP33981 857 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 DSELQ8IZU8 1212 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 M0R036 132 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SNAP91O60641 907 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 STAG3L1P0CL83 205 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 TPH1P17752 444 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 HOXC12P31275 282 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SEZ6Q53EL9 994 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 ZSWIM1Q9BR11 485 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 PTCH1Q13635 1447 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 GNB5O14775 395 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 NCAM2O15394 837 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SGPL1O95470 568 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 ADAM17P78536 824 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 CES3Q6UWW8 571 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.056e-6■■□□□ 12.3
SPTLC2-201ENST00000216484 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 C3orf18Q9UK00 162 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SNX7Q9UNH6 387 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 RARGP13631 454 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SNAPC2Q13487 334 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 TP53INP1Q96A56 240 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 PANX3Q96QZ0 392 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF221Q9UK13 617 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SLC6A2P23975 617 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 CRY2Q49AN0 593 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 KLQ9UEF7 1012 aa14.76□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 CYP2B6P20813 491 aa14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 SLC7A2P52569 658 aa14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 THOP1P52888 689 aa14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 MC1RQ01726 317 aa14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 PLET1Q6UQ28 207 aa14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 FAM131BQ86XD5 332 aa14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 QRFPRQ96P65 431 aa14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.75□□□□□ -0.05
SPTLC2-201ENST00000216484 NDUFS2O75306 463 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.9 ms