RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gprc5bQ923Z0 410 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 GhdcQ99J23 532 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nuf2Q99P69 463 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem68Q9D850 329 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cog8Q9JJA2 640 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Bace2Q9JL18 514 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Arih2Q9Z1K6 492 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Krt6bQ9Z331 562 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Myh14Q6URW6 2000 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PtproE9Q612 1226 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kdelc2G5E897 503 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sema3aO08665 772 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 JundP15066 341 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 AxlQ00993 888 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pcnx4Q3UVY5 1174 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 CcncQ62447 283 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 CyldQ80TQ2 952 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fbxw8Q8BIA4 598 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Anapc2Q8BZQ7 837 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 RtknQ8C6B2 564 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sgf29Q9DA08 293 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mpp5Q9JLB2 675 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Myh9Q8VDD5 1960 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm28168A0A087WNP1 180 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm4756A0A140LIS8 335 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm5930D3Z257 264 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfp882E9Q4R4 555 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 BC024978J3QPC3 361 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 1700122O11RikJ3QPW6 241 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm3383J3QQ59 259 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 MutP16332 748 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PctpP53808 214 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 CartptP56388 129 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sash1P59808 1230 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hipk4Q3V016 616 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sh3gl3Q62421 347 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Arhgap30Q640N3 1101 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd300aQ6SJQ0 318 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tas2r129Q7M709 320 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slfn5Q8CBA2 884 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Bag5Q8CI32 447 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Akr1c12Q9JLI0 323 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Itgb1bp2Q9R000 350 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wfdc16A2A5H4 111 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Xpnpep3B7ZMP1 506 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trim30bE9PVL6 203 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfm1O88998 485 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Il3P01586 166 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Alas2P08680 587 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc26a1P58735 704 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slfn4Q3UV66 602 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmed1Q3V009 227 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 RadilQ69Z89 1099 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lrrc4Q99PH1 652 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lpin3Q99PI4 848 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 DcpsQ9DAR7 338 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Arid3bQ9Z1N7 568 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 NinQ61043 2035 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ttc23lA6H6E9 458 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PdgfrbP05622 1098 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Krt4P07744 525 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 RhocQ62159 193 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fnip1Q68FD7 1165 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sh3rf1Q69ZI1 892 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hmgb4Q6P8W9 181 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nemp1Q6ZQE4 437 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 RfflQ6ZQM0 377 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ccdc90bQ8C3X2 256 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr589Q8VGV8 317 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cyp2c70Q91W64 489 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tfap2dQ91ZK0 452 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Necab2Q91ZP9 389 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Stard13Q923Q2 1113 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lima1Q9ERG0 753 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PignQ9R1S3 931 aa8.59□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm10717D3Z1I8 228 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm3739L7N296 216 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 P01652 108 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ccnb1P24860 430 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 AdslP54822 484 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 UtyP79457 1212 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 StacP97306 403 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PrkcqQ02111 707 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Klrb1Q0ZUP1 214 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Creb3Q61817 404 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mvb12bQ6KAU4 317 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ankzf1Q80UU1 748 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Morc4Q8BMD7 928 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gfm2Q8R2Q4 779 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pcdhb17Q91VD8 799 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dhrs7bQ99J47 323 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem81Q9D5K1 259 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gid8Q9D7M1 228 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Bcorl1A2AQH4 1781 aa8.58□□□□□ -1.04
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PatjQ63ZW7 1834 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.3 ms