RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FdpsQ920E5 353 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q922M7 232 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcg3Q99P81 650 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CoprsQ9CQ13 173 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl35Q9CZ49 574 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Commd8Q9CZG3 183 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdh7A0A0A6YY83 1255 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv5-45A0A0B4J1J1 115 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13941A2AJ38 245 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox3fA2ANE1 215 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 9230113P08RikD3YWX3 137 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r11E9Q4X4 861 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r39G3UWE6 305 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11236J3QMS7 360 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc6a13P31649 602 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcm9Q2KHI9 1134 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ag2Q3UPL5 249 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr2c1Q505F1 590 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mef2dQ63943 514 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kctd12Q6WVG3 327 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tspan33Q8R3S2 283 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cys1Q8R4T1 145 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gstm4Q8R5I6 218 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhgb1Q91XX8 918 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DeraQ91YP3 318 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr3hQ9D2C6 204 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tubb3Q9ERD7 450 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map3k6Q9WTR2 1291 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pex11bQ9Z210 259 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtm1Q9Z2C5 603 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sf3b1Q99NB9 1304 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smok3cA0A087WSF2 504 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfrsf14A0A1W2P7D5 276 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aldoart1A6ZI46 419 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfrsf11bO08712 401 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grem1O70326 184 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hcn2O88703 863 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scrg1O88745 98 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrkcdP28867 674 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpina5P70458 405 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DsppP97399 934 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TchpQ3TVW5 497 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8C5S3 137 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nle1Q8VEJ4 485 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grk2Q99MK8 689 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pak1ip1Q9DCE5 382 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ParvbQ9ES46 365 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nme3Q9WV85 169 aa12.84□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tp53bp1P70399 1969 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr271-ps1A0A1L1SQH2 283 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd2P08920 344 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myl4P09541 193 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prim2P33610 505 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd1P58544 488 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sycp3P70281 254 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q14AM7 275 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adrbk2Q3UYH7 688 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klra8Q60682 266 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd6Q69ZU8 712 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr867Q7TRF3 331 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pggt1bQ8BUY9 377 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sept10Q8C650 452 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NaprtQ8CC86 538 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lypd3Q91YK8 363 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Raver1Q9CW46 748 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pin4Q9CWW6 131 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thg1lQ9CY52 298 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syap1Q9D5V6 365 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clic3Q9D7P7 237 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PllpQ9DCU2 182 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hey2Q9QUS4 339 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RpgrQ9R0X5 1001 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Jbts17Q8CE72 3214 aa12.83□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptpn20O55082 426 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DcxO88809 366 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btg3P50615 252 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grid2ipQ0QWG9 1203 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pyroxd1Q3TMV7 498 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RgnQ64374 299 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc154Q6RUT8 657 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1198Q7TR12 308 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Got1l1Q7TSV6 404 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clic5Q8BXK9 251 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lin52Q8CD94 116 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taf10Q8K0H5 218 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cnot6Q8K3P5 557 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mkl1Q8K4J6 964 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lims2Q91XD2 341 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp4v2Q9DBW0 525 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Erap1Q9EQH2 930 aa12.83□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ism1A2ATD1 454 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rabgap1lA6H6A9 815 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930402K13RikB1AW18 415 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3187M0QWW3 260 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps6ka3P18654 740 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msx3P70354 204 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdss1Q33DR2 409 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scube1Q6NZL8 1018 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.5 ms