RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021056.7

Scn4a-201, Transcript of Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scn4a, Length 6,598 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Gdap2Q9DBL2 498 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ap3s1Q9DCR2 193 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 DguokQ9QX60 277 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Nrf1Q9WU00 503 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Bmp15Q9Z0L4 392 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Itih4A6X935 942 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Cyp2b23E9Q593 491 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Nsmce4aG3XA30 381 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Galnt4O08832 578 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Apba3O88888 571 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Slc22a8O88909 537 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Btg3P50615 252 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Mmp14P53690 582 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Q3KQP7 184 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Fam35aQ3UEN2 891 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Nek10Q3UGM2 1111 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Tmprss11aQ3UQ41 389 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Rhox12Q4TU81 186 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Il18r1Q61098 537 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ptpn21Q62136 1176 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Zc3h11aQ6NZF1 792 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Nuak2Q8BZN4 639 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Atg13Q91YI1 516 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Alg1Q921Q3 482 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Teddm3Q9CQH1 294 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Il18rapQ9Z2B1 614 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 PtpruB1AUH1 1446 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Sult2a7A0A1B0GRF0 313 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 JchainP01592 159 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Fcer2P20693 331 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Usp46P62069 366 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Them4Q3UUI3 230 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Trpv1Q704Y3 839 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Atg4cQ811C2 458 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 SvopQ8BFT9 548 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Pak5Q8C015 719 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 CcinQ8CDE2 588 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ift80Q8K057 777 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Adgrg1Q8K209 687 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Grk5Q8VEB1 590 aa9.6□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Lpar1P61793 364 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 GsapQ3TCV3 858 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Pyroxd1Q3TMV7 498 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Prickle1Q3U5C7 832 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Xlr3bQ6P205 226 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Arfrp1Q8BXL7 201 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ccz1Q8C1Y8 480 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Rab36Q8CAM5 267 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ttc39cQ8VE09 580 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Tdrd1Q99MV1 1172 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Q9D2Q3 444 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 UqcrbQ9D855 111 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Usp17lbE9Q9U0 468 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Mthfd2P18155 350 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 FpgsP48760 587 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 AdslP54822 484 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Grin2dQ03391 1323 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Trim40Q3UWA4 246 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr832Q7TRG9 312 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Lrit1Q8K099 624 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ints10Q8K2A7 710 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 BroxQ8K2Q7 411 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Chrna3Q8R4G9 499 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 GsdmcQ99NB5 468 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 MceeQ9D1I5 178 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Pik3cgQ9JHG7 1102 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Chil5A0A0G2JDS2 431 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 506 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Zscan4-ps2A0A1C7CYU6 506 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Fgf15O35622 218 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Rag1P15919 1040 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Acvr2bP27040 536 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 CartptP56388 129 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr17Q7TRM9 315 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Nat14Q8BVG8 206 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Fcho1Q8K285 873 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Acsl6Q91WC3 697 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Smim11aQ99J19 55 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Dusp10Q9ESS0 483 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr2Q9QWU6 327 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 DxoO70348 397 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 PigrO70570 771 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Rb1P13405 921 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ccnb1P24860 430 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Rps2P25444 293 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Fam83fQ3UKU4 495 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 GpamQ61586 827 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Slc20a1Q61609 681 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 GnasQ6R0H7 1133 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 P4ha3Q6W3F0 542 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Tmem214Q8BM55 687 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Zdhhc12Q8VC90 267 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Get4Q9D1H7 327 aa9.59□□□□□ -0.87
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Plod2Q9R0B9 737 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.3 ms