RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa20.81■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.81■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 ZNF567Q8N184 647 aa20.81■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 CD247P20963 164 aa20.8■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 STAMBPO95630 424 aa20.8■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 ZBTB46Q86UZ6 589 aa20.8■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 C6orf10Q5SRN2 563 aa20.79■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 ZNF786Q8N393 782 aa20.79■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 SERPINB7O75635 380 aa20.78■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 A0A1W2PPW3 197 aa20.78■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 TRIM64CA6NLI5 447 aa20.77■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 SBF1O95248 1867 aa20.77■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 FUCA1P04066 466 aa20.77■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 UGT1A6P19224 532 aa20.77■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 PITRM1Q5JRX3 1037 aa20.77■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 IER5Q5VY09 327 aa20.77■□□□□ 0.92
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