RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A51Q9H1U9 297 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 S1PR5Q9H228 398 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 SPHK2Q9NRA0 654 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC4EQ9ULY5 219 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 MTCH2Q9Y6C9 303 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX264Q9Y6I9 313 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA6CA6NDK9 693 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ZMPSTE24O75844 475 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ANXA9O76027 345 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ACSL3O95573 720 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA6DP0CG33 693 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM193AP78312 1265 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKMY2Q8IV38 441 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 PGBD5Q8N414 524 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2W6PQ8NHA6 318 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA22Q8NHS9 363 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB9Q96C00 473 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 WNT6Q9Y6F9 365 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 CBX4O00257 560 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 VIPR2P41587 438 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ARF5P84085 180 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 SPARCL1Q14515 664 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 GRIN2CQ14957 1233 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO36Q8NEA4 188 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 PYROXD1Q8WU10 500 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC39Q96DD0 335 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 RUFY1Q96T51 708 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC40Q9H9A6 602 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 TRPV4Q9HBA0 871 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 UBP1Q9NZI7 540 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS28Q9UK41 221 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTL7AQ9Y615 435 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 TBX10O75333 385 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 SHBGP04278 402 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ELK3P41970 407 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 GEMP55040 296 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 MAXP61244 160 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 LMAN2Q12907 356 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC38Q502W7 563 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ATAT1Q5SQI0 421 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 IGDCC3Q8IVU1 814 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 DCAF4L2Q8NA75 395 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 LMLNQ96KR4 655 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 SIGLEC10Q96LC7 697 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 MARK1Q9P0L2 795 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 SNAP91O60641 907 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 CD160O95971 181 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD2P08910 425 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 OLIG2Q13516 323 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF235Q14590 738 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 CES5AQ6NT32 575 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 OSCP1Q8WVF1 389 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3GL2Q99962 352 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 BBS2Q9BXC9 721 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 CASS4Q9NQ75 786 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 OBP2AQ9NY56 170 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 SEPT3Q9UH03 358 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH7Q9ULB5 785 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 REV3LO60673 3130 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 MUSKO15146 869 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 SYF2O95926 243 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 TSHRP16473 764 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 PLK1P53350 603 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ITKQ08881 620 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF844Q08AG5 666 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 NIPAL4Q0D2K0 466 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 GPS2Q13227 327 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC12A1Q13621 1099 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 LY6G5CQ5SRR4 150 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ALG1LQ6GMV1 187 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 APCDD1Q8J025 514 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 BBS5Q8N3I7 341 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ARRDC2Q8TBH0 407 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 BPIFB1Q8TDL5 484 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 PSKH2Q96QS6 385 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS51Q9UID3 782 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 CHMP2BQ9UQN3 213 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 USP12O75317 370 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP2P08253 660 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 FCARP24071 287 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 CD70P32970 193 aa25.28■■□□□ 1.64
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