RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 PDIK1LQ8N165 341 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 EDEM1Q92611 657 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 H7C0C1 242 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM63AO94886 807 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 HMBSP08397 361 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 MATKP42679 507 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 MAGEA6P43360 314 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 ATP5OP48047 213 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 NR2C2P49116 596 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 DAOAP59103 153 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 GPX6P59796 221 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 KCNJ11Q14654 390 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 HTR3DQ70Z44 454 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 PIGWQ7Z7B1 504 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 TRABD2AQ86V40 505 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.01■■□□□ 1.11
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SGMS1-210ENST00000619438 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.01■■□□□ 1.11
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SGMS1-210ENST00000619438 PATJQ8NI35 1801 aa22■■□□□ 1.11
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SGMS1-210ENST00000619438 DAB1O75553 588 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 FBXO21O94952 628 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 ADH1CP00326 375 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 CREB1P16220 341 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 SLC25A52Q3SY17 297 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 BNIPLQ7Z465 357 aa22■■□□□ 1.11
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SGMS1-210ENST00000619438 SCML4Q8N228 414 aa22■■□□□ 1.11
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SGMS1-210ENST00000619438 NT5C3BQ969T7 300 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 WBP2Q969T9 261 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 CHFRQ96EP1 664 aa22■■□□□ 1.11
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC12A8A0AV02 714 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 CYP17A1P05093 508 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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SGMS1-210ENST00000619438 MTAPQ13126 283 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 MSS51Q4VC12 460 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM196Q5HYL7 178 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa21.99■■□□□ 1.11
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SGMS1-210ENST00000619438 CKAP2Q8WWK9 683 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 SGSM3Q96HU1 749 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 PHOX2BQ99453 314 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 DHRS4Q9BTZ2 278 aa21.99■■□□□ 1.11
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SGMS1-210ENST00000619438 CHRDQ9H2X0 955 aa21.99■■□□□ 1.11
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SGMS1-210ENST00000619438 AP4E1Q9UPM8 1137 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 RASA4BC9J798 803 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA8MH3BSY2 632 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 RASA4O43374 803 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 DRD1P21728 446 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 KLHL38Q2WGJ6 581 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 ANO4Q32M45 955 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 LY6G5CQ5SRR4 150 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC34Q8IZ02 419 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.98■■□□□ 1.11
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SGMS1-210ENST00000619438 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 TBK1Q9UHD2 729 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 SPAG6O75602 509 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 STC2O76061 302 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 ADH5P11766 374 aa21.98■■□□□ 1.11
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SGMS1-210ENST00000619438 GAD2Q05329 585 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 CCINQ13939 588 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 MPP2Q14168 576 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 TMED2Q15363 201 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 OTUD6BQ8N6M0 293 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 CABS1Q96KC9 395 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 KCNK9Q9NPC2 374 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 SPHK2Q9NRA0 654 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 KCNN4O15554 427 aa21.97■■□□□ 1.11
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