RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 Q7L0L9 218 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMAD4-210ENST00000590061 DENND1CQ8IV53 801 aa7.5□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 ATPAF2Q8N5M1 289 aa7.5□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.5□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.5□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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SMAD4-210ENST00000590061 SH3RF2Q8TEC5 729 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMAD4-210ENST00000590061 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMAD4-210ENST00000590061 CLDND1Q9NY35 253 aa7.5□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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SMAD4-210ENST00000590061 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMAD4-210ENST00000590061 NPC1O15118 1278 aa7.49□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 ECI2O75521 394 aa7.49□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 HMBSP08397 361 aa7.49□□□□□ -1.21
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SMAD4-210ENST00000590061 IL4RP24394 825 aa7.49□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 NFKBIAP25963 317 aa7.49□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
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SMAD4-210ENST00000590061 NRLP54845 237 aa7.49□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 GAD2Q05329 585 aa7.49□□□□□ -1.21
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SMAD4-210ENST00000590061 LAMB3Q13751 1172 aa7.49□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.49□□□□□ -1.21
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SMAD4-210ENST00000590061 EPOPA6NHQ4 379 aa7.48□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 CHADO15335 359 aa7.48□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 GCATO75600 419 aa7.48□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 ANXA9O76027 345 aa7.48□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 CSPG5O95196 566 aa7.48□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 RHOCP08134 193 aa7.48□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 KRT10P13645 584 aa7.48□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 GLULP15104 373 aa7.48□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 PSMC3P17980 439 aa7.48□□□□□ -1.21
SMAD4-210ENST00000590061 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
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