RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589969.1

NFIC-209, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 3

Gene NFIC, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-209ENST00000589969 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 OSBPL2Q9H1P3 480 aa21.1■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.1■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 A0A1W2PQU0 124 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 ZMPSTE24O75844 475 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 NSFP46459 744 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 MAPKAPK2P49137 400 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 MYL5Q02045 173 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 CCDC14Q49A88 953 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 ARSIQ5FYB1 569 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 TMPRSS12Q86WS5 348 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 HORMAD1Q86X24 394 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 NEK11Q8NG66 645 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 GPT2Q8TD30 523 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 KLHDC7BQ96G42 594 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 TNKS2Q9H2K2 1166 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 DKK4Q9UBT3 224 aa21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 FAM208BQ5VWN6 2430 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 LGALS16A8MUM7 142 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 TAF4O00268 1085 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 EPHB6O15197 1021 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 KRT3P12035 628 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 RHOQP17081 205 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 GLDCP23378 1020 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 SYCP1Q15431 976 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 STX1AQ16623 288 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 CDO1Q16878 200 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 CCDC157Q569K6 752 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 SFMBT2Q5VUG0 894 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 PLPP6Q8IY26 295 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 DRC7Q8IY82 874 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 EID2Q8N6I1 236 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 TMEM145Q8NBT3 493 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 CHST14Q8NCH0 376 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 FAM174AQ8TBP5 190 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 ARRDC3Q96B67 414 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 HEPHQ9BQS7 1158 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.08■□□□□ 0.97
NFIC-209ENST00000589969 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 SLC31A1O15431 190 aa21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 LEFTY1O75610 366 aa21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 CALB1P05937 261 aa21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 AKT2P31751 481 aa21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 ZNF284Q2VY69 593 aa21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 CARD16Q5EG05 197 aa21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 MANEALQ5VSG8 457 aa21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 DHRS13Q6UX07 377 aa21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 PKD1L2Q7Z442 2459 aa21.07■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 RFPL3O75679 317 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 PCDH8O95206 1070 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 ITGB7P26010 798 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 DNA2P51530 1060 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 NEK3P51956 506 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 ARF5P84085 180 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 UBXN1Q04323 297 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 PTP4A2Q12974 167 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 BNIP3Q12983 259 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 ILKQ13418 452 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 NLRP14Q86W24 1093 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 C3orf20Q8ND61 904 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 JOSD2Q8TAC2 188 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 NTAN1Q96AB6 310 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 LRIG1Q96JA1 1093 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 MAGEH1Q9H213 219 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 TMEM248Q9NWD8 314 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 WASF2Q9Y6W5 498 aa21.06■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 ANKRD62A6NC57 917 aa21.05■□□□□ 0.96
NFIC-209ENST00000589969 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms