RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 ACDQ96AP0 544 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 IGSF9Q9P2J2 1179 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 NFU1Q9UMS0 254 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 C2CD4DB7Z1M9 353 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 SNAP91O60641 907 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 ERLIN1O75477 346 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 IL9P15248 144 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 SLC10A7Q0GE19 358 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF235Q14590 738 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 BRD3Q15059 726 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 PITRM1Q5JRX3 1037 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 FAM182AQ5T1J6 154 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 TEX26Q8N6G2 289 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 LMLNQ96KR4 655 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 GBA3Q9H227 469 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 ETNK1Q9HBU6 452 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 VPS51Q9UID3 782 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 FAM50BQ9Y247 325 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 E7EVH7 732 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 METTL18O95568 372 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 DGKGP49619 791 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 PRPSAP1Q14558 356 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 MORF4L2Q15014 288 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 MAP9Q49MG5 647 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 ART4Q93070 314 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 BRD9Q9H8M2 597 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 NT5MQ9NPB1 228 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 SEPT3Q9UH03 358 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 FBXO10Q9UK96 956 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 SMAPO00193 183 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 ZMPSTE24O75844 475 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 PSMB4P28070 264 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 FAXCQ5TGI0 409 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 AHI1Q8N157 1196 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 CNTD1Q8N815 330 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 GLOD4Q9HC38 313 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 SHOC2Q9UQ13 582 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 HLA-DQB2P05538 268 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 NFKB1P19838 968 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 LMAN1P49257 510 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 ARF5P84085 180 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 SULT2A1Q06520 285 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
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MEIS3-204ENST00000558555 HOOK3Q86VS8 718 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 FBXO25Q8TCJ0 367 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 CPT1BQ92523 772 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 NXPE3Q969Y0 559 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 EXOC4Q96A65 974 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 DEC1Q9P2X7 70 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC151A5D8V7 595 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 GOLGA6CA6NDK9 693 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 GOLGA6BA6NDN3 693 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 F5H423 210 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 TULP3O75386 442 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 GOLGA6DP0CG33 693 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 CD68P34810 354 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 ITKQ08881 620 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 SEMA5AQ13591 1074 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 FUT11Q495W5 492 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 ZDHHC24Q6UX98 284 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 LINGO4Q6UY18 593 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 FMO2Q99518 471 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 DYNC1I1O14576 645 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 APRTP07741 180 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 SLC20A2Q08357 652 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 GRAMD4Q6IC98 578 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 GTSE1Q9NYZ3 720 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 SLC25A13Q9UJS0 675 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 MYBL2P10244 700 aa24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 KCNJ11Q14654 390 aa24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-204ENST00000558555 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
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