RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 KLF15Q9UIH9 416 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 A0A0D9SEW6 157 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 SCAMP1O15126 338 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 UCNP55089 124 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 OXCT1P55809 520 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 STX17P56962 302 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 FZD2Q14332 565 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 ARHGAP44Q17R89 818 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 WDTC1Q8N5D0 677 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 STK32AQ8WU08 396 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 GSDMAQ96QA5 445 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 THSD1Q9NS62 852 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 COL6A6A6NMZ7 2263 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 NEMP2A6NFY4 417 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 A6NNZ2 444 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 B8ZZF3 427 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 PSMA7O14818 248 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 MED7O43513 233 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 SLC28A2O43868 658 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 LEFTY1O75610 366 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 DXOO77932 396 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 SMC2O95347 1197 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 ADCY5O95622 1261 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 SLC2A3P11169 496 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 VASPP50552 380 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 DNA2P51530 1060 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 ERVPABLB-1P60509 514 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 C1orf61Q13536 156 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 PERM1Q5SV97 790 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 OR7D4Q8NG98 312 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 LMX1AQ8TE12 382 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 CCDC34Q96HJ3 373 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 CEP63Q96MT8 703 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 PPP1R9BQ96SB3 815 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 CRACR2AQ9BSW2 395 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 MPP6Q9NZW5 540 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 IL36AQ9UHA7 158 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 CNTN6Q9UQ52 1028 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 CTNND2Q9UQB3 1225 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 MAST4O15021 2626 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 RP1P56715 2156 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 I6L893 689 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 M0QYT0 321 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 AGRPO00253 132 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 MUSKO15146 869 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 PMM2O15305 246 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 CLDN11O75508 207 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 GP1BAP07359 652 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 C6P13671 934 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 CDH4P55283 916 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 KRT83P78385 493 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 STIM1Q13586 685 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 TCEA2Q15560 299 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 TMEM259Q4ZIN3 620 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 NEK5Q6P3R8 708 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 RBFAQ8N0V3 343 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 TMIEQ8NEW7 156 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 NELFBQ8WX92 580 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 CCDC114Q96M63 670 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 SPON2Q9BUD6 331 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 DPH1Q9BZG8 443 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 CLMPQ9H6B4 373 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 PLCB1Q9NQ66 1216 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 MAN1B1Q9UKM7 699 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 HS3ST2Q9Y278 367 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-227ENST00000551441 HECTD1Q9ULT8 2610 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 CAPN8A6NHC0 703 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 BECN2A8MW95 431 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 P4HA2O15460 535 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 SPINT1O43278 529 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 AFPP02771 609 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 PRNPP04156 253 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 ERBB2P04626 1255 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 GKP32189 559 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
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