RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-216ENST00000550208 CHST14Q8NCH0 376 aa22.95■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 OR8D1Q8WZ84 308 aa22.95■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.95■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 MID1O15344 667 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 MAP3K13O43283 966 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 TMCC1O94876 653 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 IL1BP01584 269 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 DNTTP04053 509 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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BRF1-216ENST00000550208 SERPINB6P35237 376 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 PSMD8P48556 350 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 ZBTB16Q05516 673 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 CST6Q15828 149 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.94■■□□□ 1.26
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BRF1-216ENST00000550208 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 SARDHQ9UL12 918 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 ABCA7Q8IZY2 2146 aa22.94■■□□□ 1.26
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BRF1-216ENST00000550208 ZNF487B1APH4 448 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 RNF103O00237 685 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 MFSD11O43934 449 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 CTSLP07711 333 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 CHRNA3P32297 505 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 IL10RBQ08334 325 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 LLGL1Q15334 1064 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 PLK5Q496M5 336 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 FAM124AQ86V42 546 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 VSIG1Q86XK7 387 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 RFX6Q8HWS3 928 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 SPACA7Q96KW9 195 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 TM6SF2Q9BZW4 377 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 SP110Q9HB58 689 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 AMFRQ9UKV5 643 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
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BRF1-216ENST00000550208 KRT86O43790 486 aa22.92■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
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BRF1-216ENST00000550208 CDKN2BP42772 138 aa22.92■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 METAP1P53582 386 aa22.92■■□□□ 1.26
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BRF1-216ENST00000550208 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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BRF1-216ENST00000550208 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.92■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 GANCQ8TET4 914 aa22.92■■□□□ 1.26
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BRF1-216ENST00000550208 CCDC114Q96M63 670 aa22.92■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.92■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 FBXL12Q9NXK8 326 aa22.92■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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BRF1-216ENST00000550208 POM121L1PQ3SYA9 428 aa22.91■■□□□ 1.26
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BRF1-216ENST00000550208 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.91■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 PEX26Q7Z412 305 aa22.91■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 C11orf74Q86VG3 221 aa22.91■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 TMEFF1Q8IYR6 380 aa22.91■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.91■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
BRF1-216ENST00000550208 AADATQ8N5Z0 425 aa22.91■■□□□ 1.26
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