RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PCDH9Q9HC56 1237 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CD320Q9NPF0 282 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 LHX3Q9UBR4 397 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 FAM50BQ9Y247 325 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 FAM187AA6NFU0 413 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 GCATO75600 419 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TMCC1O94876 653 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 KAT7O95251 611 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 SRFP11831 508 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 SRCP12931 536 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PSMB4P28070 264 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 MMP13P45452 471 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 GALK1P51570 392 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TERF1P54274 439 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 DSC2Q02487 901 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 NIPAL4Q0D2K0 466 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 NR1H3Q13133 447 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 OLIG2Q13516 323 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TDGQ13569 410 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 SLC12A1Q13621 1099 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PPP1R7Q15435 360 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 P3H1Q32P28 736 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TEX44Q53QW1 395 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 SYCP2LQ5T4T6 812 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 EMC10Q5UCC4 262 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 DUPD1Q68J44 220 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 RNF135Q8IUD6 432 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 AHI1Q8N157 1196 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CCDC89Q8N998 374 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 DNASE1L2Q92874 299 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TTC17Q96AE7 1141 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 EXOC2Q96KP1 924 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TEKT5Q96M29 485 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PNKPQ96T60 521 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CIPCQ9C0C6 399 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 GBA3Q9H227 469 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 DPH5Q9H2P9 285 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 MTG2Q9H4K7 406 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 NT5MQ9NPB1 228 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 DEC1Q9P2X7 70 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PRKAG3Q9UGI9 489 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 DUSP12Q9UNI6 340 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 SNX24Q9Y343 169 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 F5P12259 2224 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 K7EQS6 105 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 INSIG1O15503 277 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 MTSS1O43312 755 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 OPHN1O60890 802 aa8.28□□□□□ -1.08
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CS-216ENST00000549221 EGFP01133 1207 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 MMP2P08253 660 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 NFKB1P19838 968 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CR2P20023 1033 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ECHS1P30084 290 aa8.28□□□□□ -1.08
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CS-216ENST00000549221 GUCY2DQ02846 1103 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 LMNB2Q03252 620 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 GPS1Q13098 491 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 DMC1Q14565 340 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PON2Q15165 354 aa8.28□□□□□ -1.08
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