RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 NPHS2Q9NP85 383 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 CDH23Q9H251 3354 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC12A8A0AV02 714 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 E9PAM4 449 aa20.61■□□□□ 0.89
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PACSIN3-211ENST00000539589 USP1O94782 785 aa20.61■□□□□ 0.89
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PACSIN3-211ENST00000539589 ERVK-10P10266 1014 aa20.61■□□□□ 0.89
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PACSIN3-211ENST00000539589 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.6■□□□□ 0.89
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PACSIN3-211ENST00000539589 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.6■□□□□ 0.89
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PACSIN3-211ENST00000539589 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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PACSIN3-211ENST00000539589 FCRL5Q96RD9 977 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 TCF25Q9BQ70 676 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 APOL2Q9BQE5 337 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 KLC4Q9NSK0 619 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 MPP6Q9NZW5 540 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 WASH4PA8MWX3 477 aa20.58■□□□□ 0.89
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