RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534284.1

CYCSP28-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 28, humanhuman

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Gene CYCSP28, Length 321 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP28-201ENST00000534284 SNCBQ16143 134 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 KCNMB1Q16558 191 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MPEG1Q2M385 716 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CBWD6Q4V339 395 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CBWD3Q5JTY5 395 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CBWD5Q5RIA9 395 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SMIM5Q71RC9 77 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 BEND5Q7L4P6 421 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 KRT27Q7Z3Y8 459 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 LDHDQ86WU2 507 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CCDC13Q8IYE1 715 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MPP5Q8N3R9 675 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TTLL6Q8N841 843 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CCDC89Q8N998 374 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ATG16L2Q8NAA4 619 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 KYQ8NBH2 561 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PLA2G15Q8NCC3 412 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 REPS2Q8NFH8 660 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ATP8B4Q8TF62 1192 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CD101Q93033 1021 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ART4Q93070 314 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ZBTB8AQ96BR9 441 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF653Q96CK0 615 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SNF8Q96H20 258 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TTC25Q96NG3 672 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ANKRD27Q96NW4 1050 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 C1orf43Q9BWL3 253 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 COLEC11Q9BWP8 271 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 GPR88Q9GZN0 384 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 THAP2Q9H0W7 228 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 KLC4Q9NSK0 619 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ING3Q9NXR8 418 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SENP1Q9P0U3 644 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 NCDNQ9UBB6 729 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SRRDQ9UH36 339 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TRPS1Q9UHF7 1281 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CCPG1Q9ULG6 757 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 VWA7Q9Y334 891 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RNF114Q9Y508 228 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SCINQ9Y6U3 715 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 AFF2P51816 1311 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SLX4Q8IY92 1834 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CCT8L1PA6NM43 557 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 HRKO00198 91 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 F2RL2O00254 374 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 BTN3A1O00481 513 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ATP2A1O14983 1001 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RIPK2O43353 540 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CHMP2AO43633 222 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ZBED4O75132 1171 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CDH16O75309 829 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RASSF9O75901 435 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ATP5HO75947 161 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 AGR2O95994 175 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 KNG1P01042 644 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 THP07101 528 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MMP10P09238 476 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TRIM49P0CI25 452 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TRIM49CP0CI26 452 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RAP2AP10114 183 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ATF2P15336 505 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 GYPEP15421 78 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 HDCP19113 662 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 DRD4P21917 467 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 COMTP21964 271 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 POLD1P28340 1107 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 YWHABP31946 246 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
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