RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ABCC3	O15438	1527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SHPRH	Q149N8	1683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	GRM8	O00222	908 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SOCS2	O14508	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SCP2	P22307	547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CIITA	P33076	1130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	COPB2	P35606	906 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	HAL	P42357	657 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	RGS19	P49795	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CDK18	Q07002	472 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CUL4B	Q13620	913 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MIDN	Q504T8	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	EP400	Q96L91	3159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CYP21A2	P08686	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PRF1	P14222	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ME1	P48163	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ARL4C	P56559	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CBX1	P83916	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PDCL	Q13371	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MTX1	Q13505	466 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	GALNT3	Q14435	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PTPRU	Q92729	1446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	RHOD	O00212	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms