RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ZNF284Q2VY69 593 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 NAA35Q5VZE5 725 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 RETSATQ6NUM9 610 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 FBXL19Q6PCT2 694 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 HORMAD1Q86X24 394 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A45Q8N413 288 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 MSANTD4Q8NCY6 345 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 LRIG1Q96JA1 1093 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 STK33Q9BYT3 514 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ZYG11BQ9C0D3 744 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ZNF212Q9UDV6 495 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 IL36AQ9UHA7 158 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 TRIM38O00635 465 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 LEFTY1O75610 366 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ZMPSTE24O75844 475 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 NOMO3P69849 1222 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ATP11AP98196 1134 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ILKQ13418 452 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 PROX2Q3B8N5 592 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 TCP11X2Q5H9J9 407 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SEL1L3Q68CR1 1132 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ZNF783Q6ZMS7 281 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 DRC7Q8IY82 874 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 EMC1Q8N766 993 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 EPS8L1Q8TE68 723 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 NXPE2Q96DL1 559 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 DCBLD2Q96PD2 775 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 HDAC8Q9BY41 377 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 NUP62CLQ9H1M0 184 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ATP13A1Q9HD20 1204 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 KLHL11Q9NVR0 708 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 TAB2Q9NYJ8 693 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 WASF2Q9Y6W5 498 aa17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 URB1O60287 2271 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 A0A087WV48 116 aa17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SIGLEC6O43699 453 aa17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 AKT2P31751 481 aa17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
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HERC3-211ENST00000513325 CLDN2P57739 230 aa17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ARF5P84085 180 aa17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 GNA12Q03113 381 aa17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 RAB6CQ53S08 254 aa17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ARCQ7LC44 396 aa17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 OR13H1Q8NG92 308 aa17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SLC20A1Q8WUM9 679 aa17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R16AQ96I34 528 aa17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 CALN1Q9BXU9 219 aa17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 RAB6CQ9H0N0 254 aa17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 CAAP1Q9H8G2 361 aa17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 UCKL1Q9NWZ5 548 aa17.27■□□□□ 0.36
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HERC3-211ENST00000513325 GFPT2O94808 682 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 DGKAP23743 735 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ACP1P24666 158 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 SEMG2Q02383 582 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 SLC20A2Q08357 652 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CDO1Q16878 200 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 TMEM259Q4ZIN3 620 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 GCNT7Q6ZNI0 430 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CRELD1Q96HD1 420 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 HEPHQ9BQS7 1158 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CEP44Q9C0F1 390 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ACTL7AQ9Y615 435 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 AK5Q9Y6K8 562 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa17.26■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 KNTC1P50748 2209 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 NBEAQ8NFP9 2946 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ITPR1Q14643 2758 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 FFAR2O15552 330 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CD160O95971 181 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ITGB7P26010 798 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ACVRL1P37023 503 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 KLK7P49862 253 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 NEK3P51956 506 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CDR2Q01850 454 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CARD16Q5EG05 197 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ZNF677Q86XU0 584 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 RXFP2Q8WXD0 754 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 VPS16Q9H269 839 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 GANQ9H2C0 597 aa17.25■□□□□ 0.35
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