RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 VPS4BO75351 444 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CLDN1O95832 211 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CCL4P13236 92 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 RABIFP47224 123 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 ARSDP51689 593 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 KLRB1Q12918 225 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 C1orf220Q5T0J3 134 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 MSANTD2Q6P1R3 559 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 IL22RA1Q8N6P7 574 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 ANKRD52Q8NB46 1076 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 UBA3Q8TBC4 463 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 NIF3L1Q9GZT8 377 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 VPS4AQ9UN37 437 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 ESPL1Q14674 2120 aa15.92■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 ATP9BO43861 1147 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CASP1P29466 404 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 ATP1A2P50993 1020 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 RAD23BP54727 409 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 SLC8A3P57103 927 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 DAOAP59103 153 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 C16orf72Q14CZ0 275 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 PHF19Q5T6S3 580 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CHSY1Q86X52 802 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 PCDH19Q8TAB3 1148 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CLEC4CQ8WTT0 213 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 SLC39A2Q9NP94 309 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 RNF215Q9Y6U7 377 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa15.91■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 STMND1H3BQB6 276 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 GRNP28799 593 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CHRNA3P32297 505 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 RGS7P49802 495 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 ARL10Q8N8L6 244 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CHST14Q8NCH0 376 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 OR52K2Q8NGK3 314 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 BTN2A2Q8WVV5 523 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 AZIN2Q96A70 460 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CMKLR1Q99788 373 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 IMPG2Q9BZV3 1241 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 SEMA6CQ9H3T2 930 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 DYRK4Q9NR20 520 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 SLC25A13Q9UJS0 675 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 TSPAN16Q9UKR8 245 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 DOLKQ9UPQ8 538 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa15.9■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 NF1P21359 2839 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 FPGTO14772 594 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 ALOX15BO15296 676 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 GABBR2O75899 941 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 TRIM49P0CI25 452 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 TRIM49CP0CI26 452 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 TACR2P21452 398 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 CD82P27701 267 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 GCLMP48507 274 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 SULT2A1Q06520 285 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 DEFB109BQ30KR1 87 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 FAXCQ5TGI0 409 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 C1QL3Q5VWW1 255 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 ARHGAP17Q68EM7 881 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 NYAP1Q6ZVC0 841 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 HEATR4Q86WZ0 1026 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 CCNJLQ8IV13 435 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 TEX19Q8NA77 164 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 FAM174AQ8TBP5 190 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 CASS4Q9NQ75 786 aa15.89■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 K7ERQ8 282 aa15.88■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 CNTN5O94779 1100 aa15.88■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 MT-CO1P00395 513 aa15.88■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 UGT1A3P35503 534 aa15.88■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 THOP1P52888 689 aa15.88■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 NUCB2P80303 420 aa15.88■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 ARSIQ5FYB1 569 aa15.88■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.88■□□□□ 0.13
ALYREF-204ENST00000512673 SFTPA2Q8IWL1 248 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms