RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC-201ENST00000503668 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 PFKMP08237 780 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 NFICP08651 508 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 RAG1P15918 1043 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 ME2P23368 584 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 PNPLA4P41247 253 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 HMGCS2P54868 508 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 CDH8P55286 799 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 INHBEP58166 350 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 SPEM2Q0P670 501 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 ADGRE1Q14246 886 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 CNGA3Q16281 694 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 SFT2D3Q587I9 215 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 CASC4Q6P4E1 433 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 RAPH1Q70E73 1250 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 LINC00523Q86TU6 105 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 ZNF410Q86VK4 478 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 SPATA24Q86W54 205 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 TICAM1Q8IUC6 712 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 FBXO27Q8NI29 283 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 CLPTM1LQ96KA5 538 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 ZNF778Q96MU6 729 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 TWNKQ96RR1 684 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 EFHD1Q9BUP0 239 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 DRC3Q9H069 523 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 SNX25Q9H3E2 840 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 PIDD1Q9HB75 910 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 DTLQ9NZJ0 730 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 BTBD7Q9P203 1132 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 A0A0G2JMZ2 1700 aa9.55□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 WDR27A2RRH5 827 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 C2orf71A6NGG8 1288 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 POM121CA8CG34 1229 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 MATN2O00339 956 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 ITM2AO43736 263 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 NPHS1O60500 1241 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 CD4P01730 458 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 CCDC166P0CW27 439 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 NID1P14543 1247 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 MATKP42679 507 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 RAP1GAPP47736 663 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 RPL14P50914 215 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 EPHB1P54762 984 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 TUBA4AP68366 448 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 STX5Q13190 355 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 GRIK4Q16099 956 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 SLC25A52Q3SY17 297 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 LIPMQ5VYY2 423 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 CES4AQ5XG92 561 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 SEL1L3Q68CR1 1132 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 TRNP1Q6NT89 227 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 ZYG11AQ6WRX3 759 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 ARPINQ7Z6K5 226 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 TTC30AQ86WT1 665 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 CROCCP3Q8IVE0 287 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 PHC3Q8NDX5 983 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 BEST2Q8NFU1 509 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 UBA3Q8TBC4 463 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 PYDC1Q8WXC3 89 aa9.54□□□□□ -0.88
HULC-201ENST00000503668 NTAN1Q96AB6 310 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms